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[交流]
初學者請教幾個關于VASP計算分子動力學的問題
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之前一直用VASP做基礎的構型優(yōu)化、表面吸附等基態(tài)性質(zhì)計算 最近開始嘗試進行AIMD計算 主要模擬礦物表面溶劑化和離子分子水合構型。現(xiàn)有如下幾個疑問 還望不吝賜教 1. 現(xiàn)用VASP版本為5.2.2 進行AIMD計算需要重新編譯軟件或修改makefile文件嗎？ 2. 按照http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例輸入文件嘗試模擬了一個10倍體H2O分子簇 分別設置了1000步和3000步 一直未達到收斂 求分析（INCAR如下） 3. 針對我的主要計算內(nèi)容，VASP-AIMD的一般計算步驟是什么？數(shù)據(jù)結果分析一般如何進行？ 多謝各位�。�！ QQ截圖20150515020058.jpg |
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ljw4010: 金幣+5, 謝謝指導解答！ 2015-05-15 20:09:37
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1. 現(xiàn)用VASP版本為5.2.2 進行AIMD計算需要重新編譯軟件或修改makefile文件嗎？ 一般不用，除非你要用NPT系綜或其他加速動力學方法；不過最好還是編譯一下Gamma點版本，因為MD的體系一般比較大。 2. 按照http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例輸入文件嘗試模擬了一個10倍體H2O分子簇 分別設置了1000步和3000步 一直未達到收斂 求分析（INCAR如下） 未收斂是離子步未收斂還是電子步?jīng)]收斂？最好把結果文件給出來。 3. 針對我的主要計算內(nèi)容，VASP-AIMD的一般計算步驟是什么？數(shù)據(jù)結果分析一般如何進行？ 一般步驟是先弛豫，在進行動力學模擬。數(shù)據(jù)分析可以用VMD或者自己編一些腳本處理 |
7樓2015-05-15 08:09:34
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