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mimi_pudding金蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
求教 模擬酶蛋白結(jié)合底物位點(diǎn)
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各位大俠~ 我們想研究 一種酶A能夠?qū)Φ孜顱進(jìn)行還原催化，有沒(méi)有相關(guān)的分子模擬軟件？能對(duì)酶的底物結(jié)合位點(diǎn)等進(jìn)行預(yù)測(cè)，然后給出結(jié)合該種底物的可能性？ 這只是我的預(yù)想~不知能否可行 或者有類(lèi)似的文獻(xiàn)呢？In silico之類(lèi)的？ |
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mimi_pudding
金蟲(chóng) (小有名氣)
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2樓2015-05-28 11:16:10
lxj341401
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- MolEPI: 58
- 應(yīng)助: 388 (碩士)
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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
mimi_pudding: 金幣+5, 謝謝謝謝~這么仔細(xì) 只是我不太懂這方面，抄下來(lái)慢慢消化消化~有不懂的 想再麻煩向您請(qǐng)教呀~ 2015-05-29 10:44:15
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
mimi_pudding: 金幣+5, 謝謝謝謝~這么仔細(xì) 只是我不太懂這方面，抄下來(lái)慢慢消化消化~有不懂的 想再麻煩向您請(qǐng)教呀~ 2015-05-29 10:44:15
| 從分子機(jī)理上研究一種酶A能夠?qū)Φ孜顱進(jìn)行的還原催化，如果酶A已經(jīng)有晶體結(jié)構(gòu)，可以直接使用Autodock或者Dock等軟件分子對(duì)接軟件與底物進(jìn)行分子對(duì)接，對(duì)酶和底物結(jié)合進(jìn)行預(yù)測(cè)；如果酶A還沒(méi)有空間結(jié)構(gòu)，用采用同源建模的方式（如SWISSMODEN）對(duì)酶進(jìn)行結(jié)構(gòu)模擬，然后將模擬的結(jié)構(gòu)作為受體與配體也就是底物進(jìn)行分子對(duì)接研究，分析酶與底物結(jié)合的可能方式和結(jié)合位點(diǎn)。 |
3樓2015-05-28 17:00:04
4樓2015-06-02 15:56:29
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