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zs806750658
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[交流]
LAMMPS輸出的庫倫能為什么是正值，而MS的discover算出的庫倫能是負(fù)值 已有4人參與
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| 相同的模型，相同的系宗，相同的力場，相同的參數(shù)設(shè)置，為什么用Material Studio的discover計算的單點能中庫倫能是-4萬多，而Lammps跑完輸出的能量中庫倫能是正5萬多,看過手冊發(fā)現(xiàn)兩個軟件計算庫倫能的函數(shù)是一樣的，為什么相差如此之大呢。而其他的范德華能、鍵能等相差不是很大，哪位高手能給予指點，不勝感激 |
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zs806750658 
銅蟲 (正式寫手)
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3樓2015-06-02 04:25:18
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
月只藍(lán): 金幣+3, 感謝指導(dǎo) 2015-06-02 13:05:32
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月只藍(lán): 金幣+3, 感謝指導(dǎo) 2015-06-02 13:05:32
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你用的是什么pair_style， 又是怎么把靜電能輸出的？ 如果你使用的相互作用勢利用ewald summation或 pppm 來計算靜電相互作用，那么靜電相互作用被分為短程（實空間）和長程（倒空間）兩部分進(jìn)行計算。在用thermo_style進(jìn)行輸出時，ecoul對應(yīng)于短程部分，通常是正值，elong對應(yīng)于長程部分，通常是負(fù)值，兩者之和才是總靜電相互作用能。 類似的帖子 http://simulation.haotui.com/viewthread.php?tid=23854 |
2樓2015-06-01 06:08:18
lsloneil
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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我也不是非常清楚為什么會出現(xiàn)這樣的結(jié)果。我不是很清楚Material Studio里關(guān)于ewald summation的設(shè)置。你的體系是否是電中性，如果不是電中性的話有時可能會有奇怪的結(jié)果。 假如可能的話，可以做一個簡單的測試：這個體系只包含一個正離子和一個負(fù)離子，兩者所帶電荷量相等，這樣整個體系呈電中性。然后你用Material Studio和lammps計算相同一個configruation的靜電能，看是否還會出現(xiàn)這樣奇怪的現(xiàn)象。 |
4樓2015-06-02 09:34:05
zs806750658
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felixtian5樓2015-06-03 08:07:55
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