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| 查看: 4015 | 回復(fù): 19 | ||||
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zs806750658
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[交流]
LAMMPS輸出的庫倫能為什么是正值,而MS的discover算出的庫倫能是負(fù)值 已有4人參與
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| 相同的模型,相同的系宗,相同的力場,相同的參數(shù)設(shè)置,為什么用Material Studio的discover計(jì)算的單點(diǎn)能中庫倫能是-4萬多,而Lammps跑完輸出的能量中庫倫能是正5萬多,看過手冊發(fā)現(xiàn)兩個(gè)軟件計(jì)算庫倫能的函數(shù)是一樣的,為什么相差如此之大呢。而其他的范德華能、鍵能等相差不是很大,哪位高手能給予指點(diǎn),不勝感激 |
銅蟲 (正式寫手)
專家顧問 (正式寫手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +49 |
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你用的是什么pair_style, 又是怎么把靜電能輸出的? 如果你使用的相互作用勢利用ewald summation或 pppm 來計(jì)算靜電相互作用,那么靜電相互作用被分為短程(實(shí)空間)和長程(倒空間)兩部分進(jìn)行計(jì)算。在用thermo_style進(jìn)行輸出時(shí),ecoul對應(yīng)于短程部分,通常是正值,elong對應(yīng)于長程部分,通常是負(fù)值,兩者之和才是總靜電相互作用能。 類似的帖子 http://simulation.haotui.com/viewthread.php?tid=23854 |
銅蟲 (正式寫手)
專家顧問 (正式寫手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +49 |
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我也不是非常清楚為什么會出現(xiàn)這樣的結(jié)果。我不是很清楚Material Studio里關(guān)于ewald summation的設(shè)置。你的體系是否是電中性,如果不是電中性的話有時(shí)可能會有奇怪的結(jié)果。 假如可能的話,可以做一個(gè)簡單的測試:這個(gè)體系只包含一個(gè)正離子和一個(gè)負(fù)離子,兩者所帶電荷量相等,這樣整個(gè)體系呈電中性。然后你用Material Studio和lammps計(jì)算相同一個(gè)configruation的靜電能,看是否還會出現(xiàn)這樣奇怪的現(xiàn)象。 |
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