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xiatianli888金蟲 (初入文壇)
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請教Western-Blot的抗體選擇方法?聽說題目要長 已有1人參與
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| 各位的大神,小妹最近準(zhǔn)備做Western-Blot,但是抗體選擇上有問題,我做的融合蛋白中僅是一個(gè)已有蛋白的結(jié)構(gòu)域多肽,請問還能用原蛋白一抗么?如果不能,應(yīng)該怎樣訂購這種結(jié)構(gòu)域多肽的蛋白捏~多謝~ |
蛋白質(zhì)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn) |
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金蟲 (初入文壇)
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多肽在溶液中的構(gòu)象并不穩(wěn)定,更要使用序列變位制備單克隆抗體。 α-Helix、β-sheet strand和 Random coil是三種最常見的出現(xiàn)在蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用或者蛋白質(zhì)的亞基-蛋白質(zhì)的亞基的締合體之間的接觸表面的二級(jí)結(jié)構(gòu)。而且各種蛋白質(zhì)之間或者亞基之間相互作用的接觸表面的所有的氨基酸殘基屬于各種螺旋結(jié)構(gòu)(包括α-Helix)的比例可能相當(dāng)高,甚至在一些例子中會(huì)高達(dá)接近50%,β-sheet strand, Random coil占有氨基酸殘基數(shù)量的百分比則大致為20%。當(dāng)然對于不同的蛋白質(zhì)之間或不同的亞基之間數(shù)值變化很大。對于多肽-蛋白質(zhì)相互作用的接觸表面的二級(jí)結(jié)構(gòu)類型大致也是如此,可能各類二級(jí)結(jié)構(gòu)的占有的氨基酸的比例會(huì)有些不同。所以我們需要簡要的分析一下:多肽處于溶液狀態(tài)時(shí),其包含的α-Helix、β-sheet strand和 random coil這三種的典型的二級(jí)結(jié)構(gòu)是否比較穩(wěn)定,如果它們本身就不穩(wěn)定,也就說明了多肽鏈溶液狀態(tài)的二級(jí)結(jié)構(gòu)是不穩(wěn)定的,那么如此無論用多么先進(jìn)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測軟件和分子對接軟件都無法得到唯一的計(jì)算模擬結(jié)果,因?yàn)檫@一結(jié)果本身就不存在。 |
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