東樂樂

金蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 3 (幼兒園)
金幣: 1083
帖子: 50
在線: 29.5小時
蟲號: 3562569
注冊: 2014-11-27
專業(yè): 流行病學(xué)方法與衛(wèi)生統(tǒng)計

[求助] 用組織提取總RNA后逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA進行PCR一直未有目的條帶，請大家?guī)兔Γ? 已有3人參與

我打算做質(zhì)粒構(gòu)建，但是第一步PCR就進行不下去了。采集新鮮組織后立即用Trizol法提取RNA，用takara的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒得到的cDNA，用師兄師姐留下的引物進行PCR可以擴增出相應(yīng)大小的目的條帶（約1500bp），但用我自己設(shè)計的幾對引物都不能擴增出條帶（目的條帶大�。�3564bp），只有最下面有疑似引物二聚體的條帶，其余的一條帶也沒有。我想要獲得該基因的CDS全長，之后進行細胞轉(zhuǎn)染。選的酶切位點和載體都是實驗室里現(xiàn)有的。實驗新手有很多不懂的，請大家?guī)臀蚁胂朕k法，謝謝大家！

克隆載體：19T【T-Vector pMD19(Simple)】
表達載體：pEGFP-N1

引物：（其它引物跟這個差不多就是上下幾個堿基的增減）
上游：5‘-CCCAAGCTTGCCACCATGCCTTTTGGTCTGAAGCTC-3‘[Hind III酶切位點，我引入了Kozak序列(GCCACC序列)，據(jù)說這樣有利于以后的表達]
下游：5’-CCGGAATTCTTAAATGAGTCTGGAGTTTTGGAGG-3’(EcoR I酶切位點)

體系：共25μl
高壓過的純水 16μl
10X LA PCR Buffer II (Mg2+ plus) 2.5μl
dNTP Mix 2μl
引物上游、下游各1μl
cDNA模板 2μl
Takara LA Taq 0.5μl

條件：35個循環(huán)
94℃ 2min（3min也做過）
94℃ 30s
55℃（58℃和61℃也做過）1min
72℃ 4min
72℃ 10min
4℃ ∞

CDS序列：共3564bp
ATGCCTTTTGGTCTGAAGCTCCGCCGGACACGGCGCTACAACGTCCTGAGCAAGAACTGCTTTGTCACACGGATTCGCCTGCTGGACAGCAATGTTATCGAGTGCACGCTGTCGGTGGAAAGCACAGGGCAAGAATGCCTGGAGGCTGTGGCCCAGAGGCTGGAGCTGCGAGAGACGCACTACTTTGGCCTTTGGTTTCTCAGCAAGAGCCAGCAAGCACGATGGGTGGAGCTGGAGAAACCTCTGAAGAAACATCTGGACAAATTCGCTAATGAGCCTTTGCTTTTCTTTGGAGTCATGTTCTATGTGCCAAATGTGTCATGGCTTCAGCAAGAGGCCACAAGATATCAGTATTACCTGCAAGTCAAAAAAGATGTGCTTGAAGGGCGATTACGATGTACATTGGACCAGGTGATTCGGCTAGCCGGCCTAGCTGTGCAAGCTGATTTTGGAGACTATAATCAGTTTGATTCTCAAGATTTCCTCAGAGAGTATGTGCTATTTCCTATGGATTTGGCCCTGGAAGAGGCTGTTCTGGAGGAGCTGACCCAGAAGGTAGCCCAAGAACACAAAGCCCACAGTGGAATCCTGCCAGCAGAAGCTGAACTGATGTACATCAATGAAGTTGAACGTTTGGATGGATTTGGACAGGAAATCTTCCCTGTAAAGGACAATCATGGAAACTGTGTACACCTTGGCATTTTCTTTATGGGGATTTTCGTGAGGAACAGAATTGGAAGACAAGCGGTAATATACAGGTGGAATGACATGGGGAATATCACTCATAACAAGTCGACCATTCTAGTGGAGCTCATCAACAAAGAAGAGACTGCCCTCTTTCACACGGATGATATCGAAAATGCCAAGTATATTTCTCGGTTGTTTGCCACACGACACAAGTTTTACAAACAAAACAAAATCTGCACTGAACAGTCAAATTCTCCACCCCCCATCAGACGCCAGCCCACCTGGAGCCGATCCTCTCTGCCCAGGCAGCAGCCGTACATCCTGCCTCCCGTTCACGTCCAGTGTGGTGAGCACTACTCGGAAACGCACACCTCGCAAGACAGCATTTTTCATGGGAATGAAGAAGCCTTGTATTGCAACTCTCACAACAGCCTGGACTTAAATTATTTAAATGGCACTGTCACCAATGGCAGCGTGTGTAGCGTTCACAGCGTCAACTCCCTCAACTGCTCGCAAAGTTTCATCCAGGCCTCCCCTGTATCCTCCAACCTCAGTATCCCTGGGAGTGACATCATGCGGGCCGACTACATCCCGAGCCACCGGCACAGCGCGATCATCGTGCCCTCGTACAGGCCAACCCCCGATTATGAGACAGTCATGCGCCAGATGAAGAGGGGGATCCTGCATACAGACAGCCAGAGCCAGTCTCTGAGAAACCTCAACATTATCAACACCCATGCCTACAACCAGCCAGAGGATCTGGTGTACAGCCAACCGGAGATGCGGGAGAGGCACCCCTACACTGTCCCTTATGGGCCACAGGGGGTCTACAGCAACAAACTTGTCAGTCCATCTGACCAGAGGAACCCAAAGAATAATGTGGTACCAAGCAAGCCGGGGGCAAGCGCCATCTCGCACACGGTGAGCACCCCAGAGCTGGCCAACATGCAGCTGCAGGGCAGCCATAACTACAGCACGGCCCACATGCTTAAGAACTATCTCTTCAGGCCACCGCCCCCCTACCCACGGCCACGACCTGCCACCAGCACCCCAGACCTGGCCAGCCACCGCCACAAGTACGTCAGCGGCAGCAGCCCGGACCTGGTGACCCGGAAGGTGCAGCTCTCGGTGAAGACCTTCCAAGAGGACAGCTCTCCGGTGGTTCATCAGTCTCTCCAGGAGGTGAGCGAGCCCCTCACGGCCACCAAGCACCACGGCACTGTGAACAAGCGCCACAGCCTGGAGGTGATGAACAGCATGGTGCGGGGCATGGAGGCCATGACGCTCAAGTCGCTCCACCTCCCCATGGCTCGCCGCAACACGCTCCGGGAGCAGGGACCGCCCGAGGAGGGGTCAGGCAGCCACGAGGTCCCCCAGCTCCCTCAGTATCACCACAAGAAGACCTTCTCTGATGCCACTATGCTAATCCACAGCAGCGAGAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCTCCAGAATCGGTGCCCCAGATCCCCATGCTCCGGGAGAAGATGGAGTACAGTGCCCAGCTGCAGGCGGCCCTGGCCCGCATCCCCAACAAGCCCCCGCCTGAGTACCCCGGTCCAAGGAAGAGTGTGAGCAATGGGGCTCTGAGGCAGGACCAAGCCAGCCTTCCTCCCGCCATGGCCAGAGCCAGGGTGCTGAGGCATGGGCCAGCCAAGGCCATCAGCATGTCTCGGACTGACCCGCCGGCTGTCAACGGGGCCTCTCTCGGCCCATCCATCTCGGAACCCGACCTGACTAGTGTGAAGGAGCGGGTCAAAAAAGAGCCTGTGAAGGAGAGACCTGTGTCTGAAATGTTTTCCCTGGAAGACAGCATTATAGAGAGAGAGATGATGATCAGGAATCTAGAGAAGCAGAAGATGGCAGGCCTGGAGGCACAGAAGAGGCCGCTGATGTTGGCAGCATTGAATGGGCTCTCGGTGGCTCGAGTCTCAGGGCGGGAAGAGAATCGAGTTGATGCCACCCGGGTTCCCATGGACGAGAGGTTCAGAACCCTGAAGAAGAAACTAGAAGAGGGAATGGTGTTCACAGAATATGAGCAAATTCCAAAGAAAAAGGCGAATGGCATTTTCAGCACAGCAGCTCTGCCAGAAAACGCCGAGCGCAGCCGAATCCGTGAAGTTGTCCCCTATGAGGAGAATCGAGTAGAGCTGATACCAACCAAAGAAAATAACACAGGATACATTAATGCCTCCCACATCAAGGTGGTGGTTGGCGGGGCAGAATGGCACTACATAGCCACCCAGGGGCCCCTGCCACACACGTGCCACGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGCAGGGAGTGAATGTGATTGCCATGGTCACTGCAGAGGAGGAGGGTGGACGAACCAAAAGCCACCGATACTGGCCCAAACTAGGTTCAAAGCACAGCTCAGCCACCTATGGCAAGTTCAAGGTCACCACGAAGTTTCGAACGGATTCTGTTTGCTATGCAACCACGGGCTTGAAGGTCAAGCACCTTTTGTCTGGGCAAGAAAGGACGGTGTGGCATTTACAATATACTGACTGGCCAGATCACGGCTGTCCAGAAGATGTCCAAGGATTTTTATCCTACTTGGAGGAGATCCAGTCGGTCCGTCGCCATACCAACAGCATGCTGGAAGGCACCAAGAACCGGCACCCGCCCATCGTGGTCCACTGTAGTGCTGGGGTGGGAAGGACCGGCGTGCTCATTCTTTCTGAGCTGATGATCTACTGCTTGGAACATAACGAAAAGGTGGAAGTGCCCATGATGCTGAGGCTCCTCAGGGAGCAGAGGATGTTCATGATCCAGACTATCGCTCAGTACAAGTTTGTCTACCAAGTCCTCATCCAGTTCCTCCAAAACTCCAGACTCATTTAA

總的mRNA序列：其中654bp至4217bp為CDS區(qū)域
ACTCGCACGGCCCCTTCCTCCCTCCTCTCCCGGCCGCTCGCATTTCCTGCCGCTCTGGCTCTCCCGGCCCCTCAAAGTTCTTTCCAACTTTTTCTCGGCGGAGTGAGCGCAGCGGGCGCAGACTCGGGGGCAGGTTGCTGTGCTTCTCCGGGCTCAGCCGCCTGCTCTCCTGGCTCAGGTCCTCGGGGAGCCCTAGACAGACATCAAGTGGCCACTGGCGCTCCTTCCCCTCCCAGCTGAGCCATCCTCCCCGGCCTCCTCGGGCGGGACAGCCCCGTGCTTAGGTTTTTCTCCTTTTCTCCCCCGGTGCGCCTCTGCTCGGACTCTCGCGCCGGGATCGCGGCGGAAACCTCCCTCCCCTTTCGCCTCCTGCGGCTCCTTCCCTTCGCCCCTCCTCCGCCAGTCACTGGAATCAATTCCGTGGGGAATCGGCTCCGCCGCCGCGAAGGACAGCCTTTCCGCGCGGGACTCCGGGGCGCCACGGGGGCCATGTAAGCAGCTATCTTCCAGAGGGCCACACTGGGCATGGACACCCTTTTCCCTGCCTGGAGGAGCACAGGTGATAGTGTAATTTTCCAGTCACGAAACTGCTAAGGCCATCTCAGGGGCGTGTGCGCCAGGATAGGCGGGCGGCGTCCGAGGACCACATAGCCATGCCTTTTGGTCTGAAGCTCCGCCGGACACGGCGCTACAACGTCCTGAGCAAGAACTGCTTTGTCACACGGATTCGCCTGCTGGACAGCAATGTTATCGAGTGCACGCTGTCGGTGGAAAGCACAGGGCAAGAATGCCTGGAGGCTGTGGCCCAGAGGCTGGAGCTGCGAGAGACGCACTACTTTGGCCTTTGGTTTCTCAGCAAGAGCCAGCAAGCACGATGGGTGGAGCTGGAGAAACCTCTGAAGAAACATCTGGACAAATTCGCTAATGAGCCTTTGCTTTTCTTTGGAGTCATGTTCTATGTGCCAAATGTGTCATGGCTTCAGCAAGAGGCCACAAGATATCAGTATTACCTGCAAGTCAAAAAAGATGTGCTTGAAGGGCGATTACGATGTACATTGGACCAGGTGATTCGGCTAGCCGGCCTAGCTGTGCAAGCTGATTTTGGAGACTATAATCAGTTTGATTCTCAAGATTTCCTCAGAGAGTATGTGCTATTTCCTATGGATTTGGCCCTGGAAGAGGCTGTTCTGGAGGAGCTGACCCAGAAGGTAGCCCAAGAACACAAAGCCCACAGTGGAATCCTGCCAGCAGAAGCTGAACTGATGTACATCAATGAAGTTGAACGTTTGGATGGATTTGGACAGGAAATCTTCCCTGTAAAGGACAATCATGGAAACTGTGTACACCTTGGCATTTTCTTTATGGGGATTTTCGTGAGGAACAGAATTGGAAGACAAGCGGTAATATACAGGTGGAATGACATGGGGAATATCACTCATAACAAGTCGACCATTCTAGTGGAGCTCATCAACAAAGAAGAGACTGCCCTCTTTCACACGGATGATATCGAAAATGCCAAGTATATTTCTCGGTTGTTTGCCACACGACACAAGTTTTACAAACAAAACAAAATCTGCACTGAACAGTCAAATTCTCCACCCCCCATCAGACGCCAGCCCACCTGGAGCCGATCCTCTCTGCCCAGGCAGCAGCCGTACATCCTGCCTCCCGTTCACGTCCAGTGTGGTGAGCACTACTCGGAAACGCACACCTCGCAAGACAGCATTTTTCATGGGAATGAAGAAGCCTTGTATTGCAACTCTCACAACAGCCTGGACTTAAATTATTTAAATGGCACTGTCACCAATGGCAGCGTGTGTAGCGTTCACAGCGTCAACTCCCTCAACTGCTCGCAAAGTTTCATCCAGGCCTCCCCTGTATCCTCCAACCTCAGTATCCCTGGGAGTGACATCATGCGGGCCGACTACATCCCGAGCCACCGGCACAGCGCGATCATCGTGCCCTCGTACAGGCCAACCCCCGATTATGAGACAGTCATGCGCCAGATGAAGAGGGGGATCCTGCATACAGACAGCCAGAGCCAGTCTCTGAGAAACCTCAACATTATCAACACCCATGCCTACAACCAGCCAGAGGATCTGGTGTACAGCCAACCGGAGATGCGGGAGAGGCACCCCTACACTGTCCCTTATGGGCCACAGGGGGTCTACAGCAACAAACTTGTCAGTCCATCTGACCAGAGGAACCCAAAGAATAATGTGGTACCAAGCAAGCCGGGGGCAAGCGCCATCTCGCACACGGTGAGCACCCCAGAGCTGGCCAACATGCAGCTGCAGGGCAGCCATAACTACAGCACGGCCCACATGCTTAAGAACTATCTCTTCAGGCCACCGCCCCCCTACCCACGGCCACGACCTGCCACCAGCACCCCAGACCTGGCCAGCCACCGCCACAAGTACGTCAGCGGCAGCAGCCCGGACCTGGTGACCCGGAAGGTGCAGCTCTCGGTGAAGACCTTCCAAGAGGACAGCTCTCCGGTGGTTCATCAGTCTCTCCAGGAGGTGAGCGAGCCCCTCACGGCCACCAAGCACCACGGCACTGTGAACAAGCGCCACAGCCTGGAGGTGATGAACAGCATGGTGCGGGGCATGGAGGCCATGACGCTCAAGTCGCTCCACCTCCCCATGGCTCGCCGCAACACGCTCCGGGAGCAGGGACCGCCCGAGGAGGGGTCAGGCAGCCACGAGGTCCCCCAGCTCCCTCAGTATCACCACAAGAAGACCTTCTCTGATGCCACTATGCTAATCCACAGCAGCGAGAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCTCCAGAATCGGTGCCCCAGATCCCCATGCTCCGGGAGAAGATGGAGTACAGTGCCCAGCTGCAGGCGGCCCTGGCCCGCATCCCCAACAAGCCCCCGCCTGAGTACCCCGGTCCAAGGAAGAGTGTGAGCAATGGGGCTCTGAGGCAGGACCAAGCCAGCCTTCCTCCCGCCATGGCCAGAGCCAGGGTGCTGAGGCATGGGCCAGCCAAGGCCATCAGCATGTCTCGGACTGACCCGCCGGCTGTCAACGGGGCCTCTCTCGGCCCATCCATCTCGGAACCCGACCTGACTAGTGTGAAGGAGCGGGTCAAAAAAGAGCCTGTGAAGGAGAGACCTGTGTCTGAAATGTTTTCCCTGGAAGACAGCATTATAGAGAGAGAGATGATGATCAGGAATCTAGAGAAGCAGAAGATGGCAGGCCTGGAGGCACAGAAGAGGCCGCTGATGTTGGCAGCATTGAATGGGCTCTCGGTGGCTCGAGTCTCAGGGCGGGAAGAGAATCGAGTTGATGCCACCCGGGTTCCCATGGACGAGAGGTTCAGAACCCTGAAGAAGAAACTAGAAGAGGGAATGGTGTTCACAGAATATGAGCAAATTCCAAAGAAAAAGGCGAATGGCATTTTCAGCACAGCAGCTCTGCCAGAAAACGCCGAGCGCAGCCGAATCCGTGAAGTTGTCCCCTATGAGGAGAATCGAGTAGAGCTGATACCAACCAAAGAAAATAACACAGGATACATTAATGCCTCCCACATCAAGGTGGTGGTTGGCGGGGCAGAATGGCACTACATAGCCACCCAGGGGCCCCTGCCACACACGTGCCACGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGCAGGGAGTGAATGTGATTGCCATGGTCACTGCAGAGGAGGAGGGTGGACGAACCAAAAGCCACCGATACTGGCCCAAACTAGGTTCAAAGCACAGCTCAGCCACCTATGGCAAGTTCAAGGTCACCACGAAGTTTCGAACGGATTCTGTTTGCTATGCAACCACGGGCTTGAAGGTCAAGCACCTTTTGTCTGGGCAAGAAAGGACGGTGTGGCATTTACAATATACTGACTGGCCAGATCACGGCTGTCCAGAAGATGTCCAAGGATTTTTATCCTACTTGGAGGAGATCCAGTCGGTCCGTCGCCATACCAACAGCATGCTGGAAGGCACCAAGAACCGGCACCCGCCCATCGTGGTCCACTGTAGTGCTGGGGTGGGAAGGACCGGCGTGCTCATTCTTTCTGAGCTGATGATCTACTGCTTGGAACATAACGAAAAGGTGGAAGTGCCCATGATGCTGAGGCTCCTCAGGGAGCAGAGGATGTTCATGATCCAGACTATCGCTCAGTACAAGTTTGTCTACCAAGTCCTCATCCAGTTCCTCCAAAACTCCAGACTCATTTAATCACCCCAATCCAGCTCCTGGAGGAGGGACCCAGCTCCATCGCGCTGGAGGAGAGTCACCTCCAGACAACATCTGCTCCCCCCACAGGGGTGCAGGTGGCTGGCAGCAAACAGGCTCTCTGAAGACAGTAGCCAAGATTATTCACACATACCATGTATTATTTTATATGAGATAATTTATTTTTTTCCCCTTTGGAATAACTTTTGTGAATTATTATAATGCAGTTTCCCTAGTAATATAGTACTTTTCATTTGAACCACATCTTGACTGATCTGTATTGTAATATATGTCAGCAGGTAAGGTTGCCTGCTGGATCATTTTGAGGACAGAGGCATGAGGGAGCACATCTCTTGTGAAGTTGCAGCCAGATTTGTAACCAACCCTGAAATTCATCAGCTTAATTCATTTATCAGCTTGATTCATTCATCATTCATTGCTTATATCCAAAGCAAAGACGGTAAGAAAATGAATTCATCCTGAAATATAAAGAAAAGGGTCTGAAGGAACAAACACGATTCTCTTATATTTTGGGGCTCATGAGCCTTGATAGACAGTTTCCTCTCGTCTTCATTTCCACCCCTCATCCTCAGTAGTCTCCTCTCCCCCACGCCCCACCCCAACTTCCCCCCCAAGCTTGAGTTAAAGACAGAATAGCTAAAGACAGTGCTGCCTTTACAATGCAGTAATTGCCATCTTTGGGGCCGAAAGACAAGCTCTGTGTTGTGCTTTTCTTGACCACCCCTTATCCTGGGCTCTGGAGCTTGTGTTTCCCTGCTGGCGACTGTACCTTGGGTATTTGTTGCTACCTCTCCTGTTTGCTCAGTAGGACCCTGTCTGGTGGCATTGAGGCTCTGGACCAGACCATCTGTGCAGTTAAGGCTCTACCCTGATTGAGAGAGGATAGCAGACCTAGAAAGAGAAAGGAGTTGGGCAGGGCCTTTGAGGATTGTGTTTTTCAGGCAGGGCCTTGATGATCATTGTTTTTTATTTAAATAAGATGTGTGTGCTGGACAGAGACCTAAAAGTTGAGGTCACTAAGTCATTGGAAAGGCCATCAAGGAAACAGATGGGGAAGCTGATTTATGGGAGCTGTAAGGCATTTAGCTACATAACAGGGGTCCTGGCCAGGAAACACATCAAATGTGACCCCCGCTGTGCTGATATCATCTTCAGGCTTTGGTCTGCAAGATCAGAATTAATCCCACTCGGGACCCCATAGTCCAAACTTGGGGCCACTTGATGAACGATGGTAGAATTGTCATTGGCAGAGCCCTGTGCTTCTTTCCTTTTCTTCATAAAATCCACTCGCTGGTCAGTTATCTTCACTTTGAAGCCCAGTTCTTAGTTTCTTCCTATGGCTTCATTGGTCAGTGTCCTTCTGAATTTCCAAGGATGGTACACAATAAATCATGTTTTGTACTTTTTTCCTCTTACTGCATTTTGGGGGATTTATCATTCTATGTCTACCTTTTCTTGAGTACAGCTTTGATATGCACCTGTTGTTACGTGGTGATGGGAAGTCACAGGCGTGCTCTTTCTAGTTAATTTGATGCCACATCTTCCTTGTCTTTTCAGCTTGGGAAAAAGGCGGCAGTGGAGGAAGGCATGGAATGCCCACAGTGGTCAGTTCAAAGAACAAACGTGCAATTAAAAAACTGTAGTCAGCCAGGCACGGTGGTTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAAAGGCCAAGGCGGGCAGATTGCTTGAGCTAAGGAGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATGATGAAACCCCGTCTCTACAAAAAGTACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTATGCCCTGGTAGTCCCAGCTGCTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACCTGATTCTAAGAATTCGAGACTGCAGTGAGCCGTGATCTTGCCACTGTAGTCCAGGCTGGGCTACGGAGAGACCCTGCCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAGGTTGTCAAGAAAAACTAGATGTTAGGAGAAAGGAAAATTTAATTGCAGTTTTTTTTCTTAGAATTGACTGCTGTGAGAGTTCCATATGCCTTTCTTCATTGCTGCTTTTGTCCCCCGTGAGCTAAAAAGATGGAGTGACATCAAATCAACCAGAAAAAGTATGCCTTTGTGACATCCCATCACCACATGCCAACAGGTATATATTCCCCATTAAGTTCTTCGGAATAGGAATCCTCTGTTTCAACCTGGCCAGGTGTTGTGGTGGCTGTACTCTAGTTAGACTCGGAATATCTGGGGATGGAGGGCTTCCCCTGTGTCTTCTACTTCAAGGTCTGAAGGCTCAGTGAAGGAGTATAATCTGCTGATCTTTGTAGATTCTGGAGTTTTGTTGTATGTCCTGGAAAGAAACCCATTAGTATTACATGTATTTTCAGTGAACAGAGCTTATAACCCTTATTATAAGAAGCTCATCAATAAGCAAAAAGATACTTGTTTCCTTTCCTTGGAGGTTTTTCCATCCTTGGGATATTCTGCTGTTAGGGATGTTTTAGCAAGTGGTCTCAGTTACTGGTTTATTGCGTGATGAACAACATCAGTATTTATCTTTTATCTCTAAGCCCCAAGGTGGGCACTGTTAGAATATGTCTCATGTGGACAGCATATAGATCTGGTGCGTCTTTGAGGTCGTCAGAGCTCATGGGCTTCCCTGAAATTCATCCACTGTCCCTGCCGTATGCTACGGGAATATTCATTAGTGTACAAAATGCAGGGAGGAAGTAGGTTTAATATTCAACTTTCTAGCCAAAGTTTATATTGAAACCCAAAAGAAAACATTTAAGAGTTGTTCCACATATTTCACTTTTAAAAACAAATGCCTTTGGTTCTTTAGCACATTTTGCATTCCTTTTCACATCTCCAGTAAATGCCAACATATCTCCTGTTAAATTAGCAGCAGCCATTTAAAGTCCTTTCGGTGGCATCTGCATAATAATTGCCCAGAGATGCTTTATATCTGGGAAGCAAGCCAAGGAATAAACCTTGAAGCAAAGTGTATTAAATTAGTTATCTAGTTAGAGCTTTTGGAATGATTTCCTGATGATGTATCAAGTCTGAAGCTGGAGCTGTCAGTGTCTATTGCTGCAGTTTGGATTTGAAGGGAGAAAATGTAAAATGGAGGAAAAAAAAGTTACCATCTCACAACAAAGCCATCAAACATTTTCCAGCCGCTGTTTTCGAGGTTTTCCAGTTGAACTGTTTGGTTTCTTTCATCCACACTCATTTGGATACATTGACCCGAGGTATTCATCCTTGTTTACTGTGGTCCCTGAATCATGGGGGCTGAATTTGATGTCTTCATCCTTGAGATGAGCCTGCTGGCTTAGCTGAGGAATGTCCTGCTGAGGTTTCTTAGGTTTCCTTGGGTTCTAAGGATATACTGGATATACCATCTTTTAGCAAGAGTATCTGGTAGCATTTACAGATAGCATAGACATTGGTATGCACTTCTTTCCCCAGATAGGAAGTAAAGGAGGATTTAGTTGCATGAAAAAAGGATGTTAAACATTGATTACATAGGAGTAAAGATGAATGAGCTGCAATATTCAGTCGGAGCTAAACAATAAGATCAGGGAAGGTAAAAATACCTATGTGGAATATTTTGAATCGTAAGCTTTTGAGGAGCTTAAATTGAGAGAATTTTACTTTTAATTTTGTAGATTGAGAAGAGGAACCGCTTTTTAAAATTATAGCTAAACTGTCATTGTTTTCCTAAGAGTCACTTGGCCATCTCTGGCCCCCTCTTTCATCAGCCTGAAGAGAGGGTCTTTGTAGACTGCTGAGGGTGGGCCTTGTAGGACTTGACCATGGCTTACACCTACTTAACCTTTATCCTGCTTTCTTTCAGCTTGTGCTTTTCAGTTATAAACTCCAGTGGGTACAGCAGGCTGGCCTTTTCATCCAGCTGATTATTTTTCCAGCTTAATATAGATTGACCCATATGAAATTTCCAATAATGGACCATATTTTCTGCAAATAGACAGTACTCGCATGGATCACCTATATCTTCCCCCTGATACACTGTGGGTCCCAACACCAGATGTCATTTCTCCAGAGCAGTGCTAATGAACACAAAAGGTATACCCTGGGTGGCCCAGCTCTTTTCACGAACGTGCTGCCCTGCTCATAGTGATCCTTGCATCACTTGGTGAATGGGCCATCTCCTGGGACATGGAAGTTGCAGAGGTAGATAGTGCACTGCAGCTTCTCTTAAGCCGGATTGGCCATCAGGCATATCACTCTGGAGTTTTTAGCTGCTGTCCTTTCCCGATGAACAGTCTGTATTAGCTGACCTCAGCCTACTTGTTACGTGACGTATGGGTCCCAAAAGTGTCCTTTGTCAAAAAGCAGAATGTGCCTTCTAGTCTCCCTTTCCCCATCTAATGGTGTATTCGATGGTGAAGATGAGTACAGTTGACCACCCCTATCTGTGGGTTCCACATCCCTATATTCAACCAAGTACAGATTGAAAAATATTTGGGGAAGAGGGGAAACCCACAAAGTTCCAAAAAGCAAAAGTTGAATTTGCCACATGCTGAATACTACATTGAATTCACACAAATGAAGTGATGTGTAGGCATTGAGTTAGGTATTGTAAATAATCTAGAGATGATTTAAAGTATGCAAGAGATGTGCATAGGTTATATGCAAATACTGTGCTATTTTATATAAAAGACTTGAACATCCATGGATTCTGGTATTCTCAGAGGGTCCTTGATTGCCCCCTTTGGTAAAGGACAACTATTTCGTTACTGATTTTCGTTTGGGGAAGATCTGTCAATCCCTTGAGGTGCGGGGGTTGGGGGGATGGAGGGTACAGGGCATTCTAGGATGTGTGCCAGGGAGCACAGATTCAAGGGATGGGATTGAGTCAGACCTGTGTTCTTACTCAGTGTCAGAAATAACTCTGTGGAGCTCCTAGAGTAAGACATTTCCGGAAGCACCACATAATTACTGTTGGGCTCTTAGGGTAGCCCTTTTAGGGAATTGAGCATTCCCATGTTTTACCAACAATTATTCTGCTGCTGTGTTTTATTATATTGCCAATGGTTTTGAGACACTCATCATGCTCTTATTTAGTGATTTCTTTTCATGAGCAGAGCAACAGCTCATCCAGCATGGTTTCCAAATGGAGAAATTTGGGTCTTCTGTAGAAACCACACAAATTCTCCAATGGCCTACAGCCTTATGGTTGGCACACTAGTTGGCCCTATAGGGTGGAAATAAAGCTGTAAGATGTTAAACTGCATTTGATACTTCTCTTGAACGCTGAGCAAGGAAGCAAAATAGTTCTTGTCTTTACTTAAGCTTCTAAGACATTTTGGGGCAAAGGACCTTACAGATGGCGTCTGTTGAAAGTAACAGCAACGTGCCAGGGAGAAATGTGGGGGAAATCTCATCAAATTCTGCCACCTCAAATGTGTTGTCCAGAAGTCAGTGTTATTCAGGGGGCCCTGTGAAACTTGACCACCAGCTTGCGCCATCAACACTCAGCCTTTATCCAGCCTGCTCTCAGCTTTTGTGTTTCTGTTAGAAACTCAGATAGGTAAGTATTTTTATTCAGTAGACTACCTTTCTTATCTTTTCAGCTTAATATAGCTGCATCTTCTTTCTCAAAGCCAAACTAAGATATTCTCTATTAAAATGTCCATGAGCCTAGCATTGAGTGTCTGGCATCCATCAATTTCATAGACTGGAAAATGATTGTTGTTTGGTACAGTAAAGAAGAGGATGTGCATCAGTTCCTACCGTTTGCA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回復(fù)此樓

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1樓 2015-10-16 13:30:29

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liping121200

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你的目的條帶太長了，一般情況下PCR擴增的最大片段就是3kb，你需要想其他辦法了，用擴長片段的long taq酶或者做分段克隆做拼接了

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東樂樂

好好學(xué)習(xí)，天天向上

2樓2015-10-16 15:45:27

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東樂樂

金蟲 (初入文壇)

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引用回帖:

2樓: Originally posted by liping121200 at 2015-10-16 15:45:27
你的目的條帶太長了，一般情況下PCR擴增的最大片段就是3kb，你需要想其他辦法了，用擴長片段的long taq酶或者做分段克隆做拼接了

謝謝你的回答，請問如果做分段克隆的話有什么好的建議嗎？例如酶的推薦和引物設(shè)計的經(jīng)驗?zāi)芊窒硪幌旅�？因為沒有接觸過分段克隆，請多多指教！

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3樓2015-10-19 09:05:11

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秉秉的法蘭西

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我們一般會先p個內(nèi)參看看，先確定cdna沒問題

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4樓2015-10-19 12:02:43

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秉秉的法蘭西

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我當(dāng)年也是三千多的片段，很弱，我用kod fx酶，保證性高，p了兩管收集到一起膠回收的，然后二次pcr，不過takara的反轉(zhuǎn)試劑盒的保證性不是特別高，我曾經(jīng)遇到過突變的情況

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5樓2015-10-19 12:07:31

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iayala

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你好，你的問題確實有點讓你頭疼。我嘗試著分析一下：
1. RNA有沒有斷掉，跑膠看看條帶大小對不對驗證一下；
2. 模板GC含量是否過高，考慮是否要加DMSO;
3. 嘗試槽式PCR，即設(shè)計一對兒引物，其擴增片段大小為CDS兩端各延伸一定長度，如200bp，然后用該引物的擴增產(chǎn)物作為模板，再用CDS引物擴增。
4.至于你用的酶，看說明書，看能否擴增4kb的片段，一般地，應(yīng)該沒有問題的。

祝您好運！

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6樓2015-10-19 12:10:37

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tolobio

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商家已經(jīng)主動聲明此回帖可能含有宣傳內(nèi)容

太長了。很難轉(zhuǎn)錄出這么大量完整的cDNA。還是分成幾段吧。1kb一段，分別PCR，然后再通過無縫拼接的方法克隆到一起。
建議這種體力活還是送到公司來做比較省事。這樣可以省下不少時間來看文獻，設(shè)計實驗。
如果需要的話，歡迎咨詢tolobio@126.com

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東樂樂

7樓2015-10-19 12:21:37

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董博士

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目的片段太長了，超過3Kb就算P出來也容易發(fā)生部分位點突變，這種情況還是建議分段PCR，然后連接，這種原理就是利用粘性末端連接的，每段的引物都設(shè)計的帶一點下一段的前5-10個堿基

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東樂樂

醫(yī)學(xué)&統(tǒng)計學(xué)

8樓2015-10-19 17:43:42

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sunqx

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問題很多，做好每一步，再做下一步

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9樓2015-10-19 17:55:18

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xianglixie3

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我也是～要哭了

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10樓2015-10-19 18:29:46

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