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引路者銅蟲(chóng) (初入文壇)
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RACE 反轉(zhuǎn)錄求助 已有1人參與
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本人大三學(xué)生,等著實(shí)驗(yàn)結(jié)果寫論文申請(qǐng)出國(guó)…… 現(xiàn)在卡在RACE上。 提取的mRNA經(jīng)過(guò)1%瓊脂糖電泳檢驗(yàn),結(jié)果是有兩條亮帶,很少降解。 然后反轉(zhuǎn)錄上有以個(gè)問(wèn)題: 隔壁實(shí)驗(yàn)室給的兩個(gè)接頭引物BOD(3‘端有GGG的)和AOLP(3’端有poly T的),然后用的反轉(zhuǎn)錄試劑盒是Promega的A5000 根據(jù)說(shuō)明書,采用以下操作: totalRNA 5μg AOLP 1ug 無(wú)核苷酸水(試劑盒提供) 補(bǔ)全到5ul 70℃ 預(yù)變性(應(yīng)該是這樣的目的) 5 min后立即冰浴5 min,然后任意速度離心10 s(沒(méi)有寫出速度要求,通常用7500 rpm) 反應(yīng)體系配制: 5X 的Reaction Buffer 40 ul MgCl2 (聽(tīng)說(shuō)Mg越多雜帶越少。但是擴(kuò)增的條帶越不亮) 4 ul PCR Nucleotide Mix 10 ul RRI 0.5 ul 反轉(zhuǎn)錄酶(GoScript Recerse Transcriptase) 10 ul BDO 1 ul 用提供的Water調(diào)制 15 .0ul 冰上混合變性的RNA和反應(yīng)體系 25℃ 5min 42℃ 1h 70℃ 15min 現(xiàn)在問(wèn)題是,隔壁實(shí)驗(yàn)室給的體系和我買的體系稍有不同, 他們用37℃(DNase Buffer、RQ DNase,RRI,RNA和水配制成體系)處理后用加 AOLP和stop solution 70℃孵育( 終止延伸用,說(shuō)讓后來(lái)的BOD結(jié)合上去) 然后在進(jìn)行第一鏈cNDA合成,這時(shí)候才加BDO。 不知道以我的那種方法來(lái)做能不能達(dá)到同樣的效果。就在在反轉(zhuǎn)錄的時(shí)候在5‘端加上BDO序列。 求助求助。! |

新蟲(chóng) (小有名氣)
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銅蟲(chóng) (初入文壇)

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