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如何鑒定一株分離得到的內(nèi)生真菌是否為新種??? 已有1人參與
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本人剛剛開始接觸植物內(nèi)生真菌,有些問題想請教下。目前,有一株分離自植物的炭角菌,是我一個畢業(yè)了的師姐分離出來的。她當時測了這株真菌的ITS片段序列,NCBI數(shù)據(jù)庫的比對結(jié)果和某種炭角菌相似度達到98%,然后又測了該株真菌的RPB2片段序列,序列對比結(jié)果和另外某種炭角菌相似度達98%,又結(jié)合部分形態(tài)特征,依此鑒定為炭角菌,但是我不明白她為什么畢業(yè)論文中說是分離到炭角菌新種? 我看論壇中有人說序列相似度在97%以下,才有可能是新種。另外,當時師姐沒能誘導產(chǎn)子囊殼和孢子,只拍了子座的顯微結(jié)構(gòu),我們導師(對真菌了解不多)現(xiàn)在想讓我試試誘導產(chǎn)孢,寫一篇真菌新種發(fā)布的文章。但是根據(jù)序列相似度,我現(xiàn)在懷疑當時分離到的可能就不是新種。所以想請教下大家,否則后邊的誘導實驗都是徒勞。另外,我看了一些新種的發(fā)布文章,都是只涉及性狀和顯微結(jié)構(gòu)的描述,好像也沒有說要把分子鑒定的寫上去。啃“,虛心求教。 |
木蟲 (小有名氣)
新蟲 (正式寫手)
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序列比對,顯微結(jié)構(gòu)觀察,比較不同差異很大!就可以!我原來做的一株蟲草,基因序列單基因,多基因比對都有差異不是很大!但是產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)差異很大! 又和相似那個菌株做培養(yǎng),結(jié)構(gòu)比對!就可以了! 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (正式寫手)
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