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[求助]
如何鑒定一株分離得到的內(nèi)生真菌是否為新種？？？ 已有1人參與
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本人剛剛開始接觸植物內(nèi)生真菌，有些問題想請教下。目前，有一株分離自植物的炭角菌，是我一個畢業(yè)了的師姐分離出來的。她當(dāng)時測了這株真菌的ITS片段序列，NCBI數(shù)據(jù)庫的比對結(jié)果和某種炭角菌相似度達(dá)到98%，然后又測了該株真菌的RPB2片段序列，序列對比結(jié)果和另外某種炭角菌相似度達(dá)98%，又結(jié)合部分形態(tài)特征，依此鑒定為炭角菌，但是我不明白她為什么畢業(yè)論文中說是分離到炭角菌新種？ 我看論壇中有人說序列相似度在97%以下，才有可能是新種。另外，當(dāng)時師姐沒能誘導(dǎo)產(chǎn)子囊殼和孢子，只拍了子座的顯微結(jié)構(gòu)，我們導(dǎo)師（對真菌了解不多）現(xiàn)在想讓我試試誘導(dǎo)產(chǎn)孢，寫一篇真菌新種發(fā)布的文章。但是根據(jù)序列相似度，我現(xiàn)在懷疑當(dāng)時分離到的可能就不是新種。所以想請教下大家，否則后邊的誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)都是徒勞。另外，我看了一些新種的發(fā)布文章，都是只涉及性狀和顯微結(jié)構(gòu)的描述，好像也沒有說要把分子鑒定的寫上去啊？小白，虛心求教。 |
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- 專業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)
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序列比對，顯微結(jié)構(gòu)觀察，比較不同差異很大！就可以！我原來做的一株蟲草，基因序列單基因，多基因比對都有差異不是很大！但是產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)差異很大！ 又和相似那個菌株做培養(yǎng)，結(jié)構(gòu)比對！就可以了！ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2016-01-15 14:18:39
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