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xk6891至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[交流]
【討論】關(guān)于md中系統(tǒng)穩(wěn)定的問(wèn)題 已有3人參與
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小蟲(chóng)初涉md，問(wèn)一個(gè)弱弱的問(wèn)題 作完結(jié)構(gòu)優(yōu)化之后，看很多網(wǎng)上的資料都要求系統(tǒng)在熱浴的環(huán)境中（是不是準(zhǔn)確的應(yīng)該說(shuō)是在一定的系綜下）跑一會(huì)兒，意思是說(shuō)希望系統(tǒng)能在這個(gè)環(huán)境中穩(wěn)定，如何判斷系統(tǒng)在這個(gè)環(huán)境中是否達(dá)到了穩(wěn)定？穩(wěn)定之后，在做以下的性質(zhì)計(jì)算時(shí)，是否還需要這個(gè)系綜（譬如Nose Hoover熱�。┑年P(guān)鍵詞？ 急盼各位高手拍磚，謝謝  |
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manutdhk
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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+5):謝謝 2010-10-14 10:24:04
lei0736(模擬EPI+1):呵呵 歡迎您的指點(diǎn) 2010-10-14 10:24:52
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lei0736(模擬EPI+1):呵呵 歡迎您的指點(diǎn) 2010-10-14 10:24:52
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不敢當(dāng)前輩，看到這詞，如坐針氈啊。大家一起交流，以版友相稱就好了。。 模擬退火，我不是很熟。但是退火的意思，就是將體系從高溫，一下子降到某個(gè)低溫。這是一種找極小值的最簡(jiǎn)單的方法而已。 各態(tài)歷經(jīng)的假說(shuō)，你理解錯(cuò)了。1. 相空間里的狀態(tài)點(diǎn)，是指系統(tǒng)的狀態(tài)，跟粒子數(shù)沒(méi)有關(guān)系。2. 各態(tài)歷經(jīng)，是指 在相當(dāng)長(zhǎng)的時(shí)間里，系統(tǒng)總能歷經(jīng) 相空間里的 各種可能達(dá)到的 狀態(tài)點(diǎn)。 原子的自由度，是指描述一個(gè)微觀系統(tǒng)需要的物理量。譬如在相空間，我們需要 6N 個(gè)自由度，3N個(gè)坐標(biāo)和3N個(gè)速度（或者動(dòng)量），來(lái)描述體系的狀態(tài)點(diǎn)。也可以用體系的能量作為自變量……等等。具體的宏觀量，一個(gè)典型的就是溫度；按照經(jīng)典統(tǒng)計(jì)來(lái)說(shuō)，系統(tǒng)的溫度與原子的平均動(dòng)能相對(duì)應(yīng)。平均動(dòng)能，就是原子自由度的一部分（動(dòng)量或速度）。再譬如，壓強(qiáng)，其微觀對(duì)應(yīng)比較復(fù)雜，但也只是包含了，原子的坐標(biāo)，速度，和相互作用力而已，都是原子的自由度。 關(guān)于這些問(wèn)題，我覺(jué)得你還需要看一些書(shū)，北大版的《熱力學(xué)與統(tǒng)計(jì)物理學(xué)》（林宗涵 著）， J. M. Haile 的 《Molecular dynamics simulation——elementary methods》就是不錯(cuò)的。 |
9樓2010-10-14 09:31:00
xk6891
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不好意思，自己頂一下 2樓2010-10-13 13:12:04
manutdhk
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ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-10-13 17:02:14
xk6891(金幣+5): 2010-10-13 18:18:06
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xk6891(金幣+5): 2010-10-13 18:18:06
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首先，不知道你要做什么性質(zhì)的計(jì)算，平衡態(tài)還是非平衡態(tài)？ 如果是平衡態(tài)的計(jì)算，所謂的穩(wěn)定，確切地說(shuō)應(yīng)該是 熱力學(xué)平衡。對(duì)于一個(gè)熱力學(xué)系統(tǒng)，平衡是指 系統(tǒng)達(dá)到 吉布斯分布。NVT系綜下，系統(tǒng)的溫度與 熱浴溫度一致，能量在一定平衡值附近振蕩……等等。 至于計(jì)算平衡態(tài)性質(zhì)，是否需要繼續(xù)保持該系綜，理論上來(lái)說(shuō) 其實(shí)問(wèn)題不大。根據(jù)統(tǒng)計(jì)物理學(xué)原理，NVE系綜和NVT系綜，在熱力學(xué)極限下，得到的結(jié)果是相一致的。 |
3樓2010-10-13 15:36:56
xk6891
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zh1987hs(金幣+3):鼓勵(lì)交流 2010-10-13 18:59:19
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先謝謝指導(dǎo)，呵呵，提的問(wèn)題太不專(zhuān)業(yè)了。是平衡態(tài)，這一點(diǎn)應(yīng)該說(shuō)明�？梢赃@樣說(shuō)么，譬如NVT系綜，md結(jié)果當(dāng)中ions的溫度和electrons的動(dòng)能應(yīng)該在nose hoover設(shè)定的溫度和動(dòng)能值附近震蕩，且粒子數(shù)目和所計(jì)算系統(tǒng)體積（晶胞大�。┎蛔儯@就可以說(shuō)這個(gè)系統(tǒng)符合了NVT的系綜，這個(gè)系統(tǒng)就穩(wěn)定了。而如果是NPT系綜就看輸出文件中系統(tǒng)的壓力和溫度值的變化，如果其在設(shè)定值周?chē)鹗�，就可以說(shuō)系統(tǒng)平衡了。 同時(shí)由于系統(tǒng)已經(jīng)平衡了，可以認(rèn)為系統(tǒng)已經(jīng)滿足了熱力學(xué)極限的條件，此時(shí)在什么系綜下已經(jīng)不重要了，因?yàn)楦鱾�(gè)系綜的情況已經(jīng)相同。按照在某一系綜下穩(wěn)定的系統(tǒng)，再計(jì)算性質(zhì)，加不加關(guān)鍵詞以不重要。 不知這樣理解是否正確？還請(qǐng)賜教  |
4樓2010-10-13 18:40:35
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