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[交流]
【求助/交流】pGEM-T Easy載體 T-A 連接 為啥沒連入PCR產(chǎn)物的 菌斑是藍(lán)斑
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| T載體如果不跟PCR產(chǎn)物連接, 不是由于T末端,自己不能自連嗎? 這樣不應(yīng)該lacZ基因中間斷裂 不能表達(dá)嗎? 為什么沒有連接PCR產(chǎn)物的菌班是藍(lán)色的呢? |
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如果你們清楚T載體是怎么做出來(lái)的,就知道蘭斑怎么來(lái)的了。 如果真的是兩端都是T頭,這個(gè)T載體是無(wú)法自連起來(lái)的。 但是為什么會(huì)有自連呢?是因?yàn)樵谥谱鱐載體的過(guò)程中,除了兩頭是T的情況,不可避免的會(huì)還有一頭是T突出,一頭是平端(這個(gè)殘留,但是也無(wú)法自連),或者兩頭是平端,或者是一頭是T頭,一頭是A頭,或者干脆就是微量的原始環(huán)狀質(zhì)粒無(wú)法完全分開,微量的環(huán)狀原始質(zhì);煸诰性T載體成品里面。除了第一種情況一頭T頭,一頭平端無(wú)法連接。其它幾種情況加連接酶連接后,都會(huì)表現(xiàn)出環(huán)狀的質(zhì)粒,也就是藍(lán)斑點(diǎn)了。至于為什么會(huì)混雜這幾種東西,就牽涉到了基礎(chǔ)的原理,和方法了,自己去查資料吧。 做T載體的工藝,就是盡可能的做到,全部是兩頭T頭的載體,這樣理論上就不會(huì)有籃斑了。但是這是不可能的,總會(huì)混雜上面幾種情況造成藍(lán)斑。混雜越多,藍(lán)斑比例越多。也就是說(shuō)明了T載體質(zhì)量越差。這個(gè)是判斷T載體好壞的一個(gè)最重要指標(biāo)之一。 加T和酶切T載體的方法,沒有可能達(dá)到100%不混雜上面幾種情況。但是本公司做的T載體工藝,藍(lán)色斑點(diǎn)小于10%,很多情況下小于5%,質(zhì)量已經(jīng)是達(dá)到頂級(jí)水平。其它公司很多工藝無(wú)法達(dá)到,就會(huì)出現(xiàn)較多的籃斑,或者兩邊T頭掉了后,兩端成了平端破壞讀碼框自連成白斑的假陽(yáng)性情況。 |
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建議樓主好好看看藍(lán)白斑的基本原理~~~~~~~ 如果PCR產(chǎn)物插入了MCS位點(diǎn),則LAZ基因被截?cái),不能表達(dá),則克隆菌呈白色。 如果沒插入MCS位點(diǎn),而是自連的話,LAZ基因能表達(dá),表達(dá)后產(chǎn)物與X-gal產(chǎn)生反應(yīng),變成藍(lán)色藍(lán)色。 T載體由于制作的問題,是會(huì)有自連得。如果沒有自連的話 ,轉(zhuǎn)入細(xì)菌,抗生素基因不能表達(dá),細(xì)菌就不能在有抗生素的平板上生長(zhǎng)。那么就不會(huì)產(chǎn)生菌落,產(chǎn)生了菌落的都是含有環(huán)形質(zhì)粒的。 至于T載體為什么會(huì)自連,可以看下T載體是怎么生產(chǎn)的,一般都是用Eco5酶切出平末端,然后再平末端上加T尾,加T尾的效率并不是百分百的。 |
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