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[交流]
【求助】蛋白提取
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| 請問下酸會影響提細菌蛋白嗎?因為我需要將培養(yǎng)基中的難溶磷用酸溶掉才能得到菌體。謝謝。另外,提出的蛋白可以直接雙向電泳嗎? |
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1)既然是找菌體差異蛋白,那應該是全菌體蛋白。 怎么是用硫酸銨來沉淀菌體蛋白呢? 全菌體蛋白的提取就是用 2D電泳的 Loading buffer (里面主要的是尿素或硫脲,還有些非離子表面活性劑等等。。這要看你的優(yōu)化條件)。 你分離出細胞就可以了。不需要硫酸銨沉淀蛋白,再說硫酸銨沉淀蛋白不可能時完全的,對于你找群體差異蛋白造成很大干擾。 按照你的情況,發(fā)酵液離心得到磷酸鈣和菌體沉淀,然后用緩沖液重懸,再離心沉淀,然后就加蛋白提取液 。(2D電泳膜蛋白提取 好像也有試劑盒的,比較貴些。。。你也可以選擇最近的文獻中 全細胞提取 尤其是膜蛋白提取的配方) 2)菌體產酸 對全菌體蛋白提取過程不會有什么影響。 因為你要發(fā)酵液離心(1 mL 發(fā)酵液足夠了),然后用4℃ 0.9% NaCl 洗滌一下,再離心,直接加 全菌體蛋白提取液。 離心機最好選用高速的。例如 10000 rpm--30 sec 就基本可以離心下菌體細胞了。這個洗滌過程操作也就1-2min時間。 |
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后面看到,你的蛋白是用來做雙向電泳的,而不是測活的。 因此,低pH的酸應該影響不到蛋白吧。 關鍵是你加酸量有多少? 難道要加100 mM的HCl處理 一小時? 那菌體估計都要破掉了。 你的菌體的獲得很麻煩嗎?難道是生長在磷酸鈣之類的上面? 菌體提取的蛋白,要分成幾類: 1)最簡單的,可溶性上清中的蛋白: 去除鹽類后,可以做雙向電泳的樣品。 2)膜蛋白,因為可溶性差,需要特殊的試劑處理,增加其在第一維電泳時的可溶性。具體的你得去查論文,這里只是提示一下。 另外,實際上,對于全細胞蛋白,雙向電泳許多時候會過濾掉很多蛋白點的! 選擇雙向電泳Loading buffer 組分很關鍵。 |
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