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qiang7金蟲 (小有名氣)
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[求助]
Western Blot電泳蛋白質外漏問題求助
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求助各位高手指點,本人最近蛋白電泳過程中經(jīng)常出現(xiàn)在蛋白樣品剛跑離樣品孔還沒進入分離膠的時候,樣品就漏下來了!如下圖所示。在我想的問題都找遍了,比如濃縮膠濃縮時間,玻璃板清洗問題及玻璃板都換新的了,還有試劑都換了一套,還是漏 真不知道還有什么致命因素沒有找到,請各位大俠指點!小弟將不勝感激! |
蛋白質生物學實驗經(jīng)驗 | 核酸生物學實驗經(jīng)驗 | 蛋白電泳 漏樣 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
鐵桿小蟲
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肯定是你液體配制中的問題,這是我的配方,可以參考一下。 1. 試劑配制 1.1母液 1.1.1 1.0mol/L Tris•HCl Tris (MW121.14) 30.29g 蒸餾水 200ml 溶解后,用濃鹽酸調pH至所需點(見下所示),最后用蒸餾水定容至250ml,高溫滅菌后室溫下保存。 PH HCl 7.4 約17ml 7.5 約16m 7.6 約15ml 8.0 約10ml 1.1.2 1.74mg/ml (10mmol/L)PMSF PMSF 0.174g 異丙醇 100ml 溶解后,分裝于1.5ml離心管中,-20℃保存。 1.1.3 0.2mol/L NaH2PO4 NaH2PO4(MW119.98) 12g 蒸餾水至 500ml 溶解后,高壓滅菌,室溫保存。 1.1.4 0.2mol/LNa2HPO4 Na2HPO •12H2O(MW 358.14) 71.6g 蒸餾水至 1000ml 溶解后,高壓滅菌,室溫保存。 1.1.5 10%SDS SDS 10g 蒸餾水至 100ml 50℃水浴下溶解,室溫保存。如在長期保存中出現(xiàn)沉淀,水浴溶化后,仍可使用。 1.1.6 10%過硫酸胺(AP) 過硫酸胺 0.1g 超純水 1.0ml 溶解后,4℃保存,保存時間為1周。 (可先將過硫酸胺干粉稱好分量后放在EP管中,一次性多裝幾管,使用時加入超純水即可) 1.1.7 1.5mol/L Tris•HCl(pH8.8) Tris (MW121.14) 45.43g 超純水 200ml 溶解后,用濃鹽酸調pH至8.8,最后用超純水定容至250ml,室溫下保存。 1.1.8 0.5mol/L Tris•HCl(pH6.8) Tris (MW121.14) 15.14g 超純水 200ml 溶解后,用濃鹽酸調pH至6.8,最后用超純水定容至250ml,室溫下保存。 1.1.9 40%Acr/Bic(37.5:1) 丙稀酰胺(Acr) 37.5g 甲叉雙丙稀酰胺(Bic) 1g 超純水至 100ml 溶解后4℃保存。使用時恢復至室溫且無沉淀。 1.1.10 30%Acr/Bic(29:1) 丙稀酰胺(Acr) 29g 甲叉雙丙稀酰胺(Bic) 1g 超純水至 100ml 溶解后4℃保存。使用時恢復至室溫且無沉淀。 1.1.11 20%Tween20 Tween20 20ml 蒸餾水至 100ml 混勻后4℃保存。 1.2 使用液配制 1.2.1 單去污劑裂解液(PMSF): 1mol/L Tris•HCl(pH8.0) 2.5ml NaCl 0.438g TritonX-100 0.5ml 蒸餾水至 50ml 混勻后4℃保存。使用時,加入PMSF至終濃度為100μg/ml(0.87ml裂解液加入1.74mg/ml PMSF50μl)。 一般實際用的比較多的其實是RIPA-Radio Immunoprecipitation Assay裂解配方: 50 mM Tris-HCl pH 7.4、150 mM NaCl、1 mM PMSF、1 mM EDTA、1% Triton X-100、1%脫氧膽酸鈉、0.1% SDS。 裂解得到的蛋白樣品,由于含有較高的蛋白去垢劑干擾,不能用Brandford法測定蛋白濃度,要用BCA蛋白定量試劑盒測定蛋白濃度。 RIPA裂解液的配方有很多種,根據(jù)其裂解液的強度大致可以分為強、中、弱三類。對于某些特殊蛋白的IP,如果發(fā)現(xiàn)Western及IP細胞裂解液(弱)效果不是非常理想,可以嘗試用RIPA裂解液(強、中或弱)。如果發(fā)現(xiàn)IP的時候背景很高,即非特異的蛋白也被IP下來,則需要選用裂解強度較高的裂解液,例如RIPA裂解液(強或中)。如果發(fā)現(xiàn)目的蛋白無法被IP下來,則說明裂解液的強度過強,可以使用較為溫和的裂解液例如RIPA裂解液(弱)或NP-40裂解液。 對于某些難溶解蛋白的Western,如果發(fā)現(xiàn)Western及IP細胞裂解液(弱)效果不是非常理想,可以嘗試使用裂解強度更高的裂解液例如RIPA裂解液(強、中)或SDS裂解液。 1.2.2 0.01mol/L PBS( pH 7.2-7.4) 0.2 mol/L NaH2PO4 19ml 0.2 mol/L Na2HPO4 81ml NaCl 17g 蒸餾水至 2000ml 1.2.3 G250考馬斯亮藍溶液(蛋白定量專用) 考馬斯亮藍G250 100mg 95%乙醇 50ml 磷酸 100ml 蒸餾水至 1000ml 配制時,先用乙醇溶解考馬斯亮藍染料,再加入磷酸和水,混勻后,用濾紙過濾,4℃保存。 1.2.4 0.15 mol/L NaCl NaCl(MW58.44) 0.877g 蒸餾水至 100 ml 高溫滅菌后,室溫保存。 1.2.5 100mg/ml 牛血清白蛋白(BSA) BSA 0.1g 0.15 mol/L NaCl 1ml 溶解后-20℃保存。制作蛋白標準曲線時,用0.15 mol/L NaCl進行100倍稀釋成1mg/ml,-20℃保存。 1.2.6 還原型5 X SDS上樣緩沖液 0.5 mol/L Tris•HCl(pH6.8) 2.5ml 二硫叔糖醇(DTT,MW154.5) 0.39g SDS 0.5g 溴酚藍 0.025 甘油 2.5ml 混勻后,分裝于1.5ml離心管中,4℃保存。 1.2.7 電泳液緩沖液 Tris(MW121.14) 3.03g 甘氨酸(MW75.07) 18.77g SDS 1g 蒸餾水至 1000ml 溶解后室溫保存,次溶液可重復使用3~5次。 (電泳液可以回收重復利用,一般將回收的電泳液加入垂直電泳槽的下半部分,上半部分最好使用新鮮的電泳緩沖液) 1.2.8 轉移緩沖液 甘氨酸(MW75.07) 2.9g Tris(MW121.14) 5.8g SDS 0.37g 甲醇 200ml 蒸餾水至 1000ml 溶解后室溫保存,次溶液可重復使用3~5次(次溶液最好保存在4度冰箱,最多使用5次左右,不然影響轉移效率)。 (先用蒸餾水溶解甘氨酸、Tris和SDS,然后再加入甲醇,最后補足液體。如果先加入甲醇,溶解甘氨酸、Tris和SDS等比較困難) 1.2.9 10X麗春紅染液 麗春紅S 2g 三氯乙酸 30g 磺基水楊酸 30g 蒸餾水至 100ml 使用時將其稀釋10倍。 1.2.10 TBS緩沖液 1 mol/L Tris•HCl(pH7.5) 10ml NaCl 8.8g 蒸餾水至 1000ml (可以配制成10×TBS緩沖液進行保存,稀釋10倍使用) 1.2.10 TBST緩沖液 20%Tween20 1.65ml TBS 700ml 混勻后即可使用,最好現(xiàn)用現(xiàn)配。 1.2.11 封閉液 (最好現(xiàn)配現(xiàn)用) 脫脂奶粉(國產(chǎn),光明牌) 5g TBST 100ml 1.2.12 洗脫抗體緩沖液(可用可不用) 14.4 mol/L 2- Mercaptoethanol(β-巰基乙醇) 700 μl(通風廚里加) SDS 2g 0.5mol/L Tris•HCl(pH6.8) 12.5ml 超純水至 100ml 配制時,在通風廚內進行。4℃保存?芍貜褪褂1次。 1.2.18 40%聚丙烯酰胺的濃縮膠和分離膠配制 組 分 10%分離膠(兩塊膠,10ml) 4%濃縮膠(兩塊膠,5ml) 超純水 4.85ml 3.16ml 40%Acr/Bic(37.5:1) 2.5ml 0.5ml 1.5 mol/L Tris•HCl(pH8.8) 2.5ml - 0.5 mol/L Tris•HCl(pH6.8) - 1.26ml 10% SDS 100 μl 50 μl 10% AP 50 μl 25μl TEMED 5 μl 5 μl *加TEMED后,立即混勻即可灌膠。(為了加快凝膠,可以將過硫酸胺和TEMED量加大,一般加至原來的2-3倍,根據(jù)實驗當時的溫度適當調整) 組 分 15%分離膠(兩塊膠,10ml) 7.8%濃縮膠(兩塊膠,5ml) 超純水 2.34 ml 2.065 ml 40% Acr/Bic(37.5:1) 3.75 ml 0.975 ml 1.5 mol/L Tris•HCl(pH8.8) 3.75 ml - 0.5 mol/L Tris•HCl(pH6.8) - 1.875 ml 10% SDS 100 μl 50 μl 10% AP 50 μl 25μl TEMED 10μl 5 μl 1.2.19 30%聚丙烯酰胺的濃縮膠和分離膠配制 SDS聚丙烯酰胺凝膠的有效分離范圍 *丙烯酰胺濃度(%) 線性分離范圍(kD) 15 12~43 10 16~68 7.5 36~94 5.0 57~212 *雙丙烯酰胺~丙烯酰胺摩爾比為 1:29。 配制Tris-甘氨酸SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳分離膠溶液 溶液成分 總體積 5ml 總體積 10ml 總體積 15ml 總體積 20ml 總體積 25ml 總體積 30ml 6% 水 2.6ml 5.3ml 7.9ml 10.6ml 13.2ml 15.9ml 30%丙烯酰胺 1.0ml 2.0ml 3.0ml 4.0ml 5.0ml 6.0ml 1.5M Tris(pH 8.8) 1.3ml 2.5ml 3.8ml 5.0ml 6.3ml 7.5ml 10% SDS 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl 10%過硫酸胺 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl TEMED 4μl 8μl 12μl 16μl 20μl 24μl 8% 水 2.3ml 4.6ml 6.9ml 9.3ml 11.5ml 13.9ml 30%丙烯酰胺 1.3ml 2.7ml 4.0ml 5.3ml 6.7ml 8.0ml 1.5M Tris(pH 8.8) 1.3ml 2.5ml 3.8ml 5.0ml 6.3ml 7.5ml 10% SDS 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl 10%過硫酸胺 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl TEMED 3μl 6μl 9μl 12μl 15μl 18μl 10% 水 1.9ml 4.0ml 5.9ml 7.9ml 9.9ml 11.9ml 30%丙烯酰胺 1.7ml 3.3ml 5.0ml 6.7ml 8.3ml 10.0ml 1.5M Tris(pH 8.8) 1.3ml 2.5ml 3.8ml 5.0ml 6.3ml 7.5ml 10% SDS 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl 10%過硫酸胺 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl TEMED 2μl 4μl 6μl 8μl 10μl 12μl 12% 水 1.6ml 3.3ml 4.9ml 6.6ml 8.2ml 9.9ml 30%丙烯酰胺 2.0ml 4.0ml 6.0ml 8.0ml 10.0ml 12.0ml 1.5M Tris(pH 8.8) 1.3ml 2.5ml 3.8ml 5.0ml 6.3ml 7.5ml 10% SDS 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl 10%過硫酸胺 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl TEMED 2μl 4μl 6μl 8μl 10μl 12μl 15% 水 1.1ml 2.3ml 3.4ml 4.6ml 5.7ml 6.9ml 30%丙烯酰胺 2.5ml 5.0ml 7.5ml 10.0ml 12.5ml 15.0ml 1.5M Tris(pH 8.8) 1.3ml 2.5ml 3.8ml 5.0ml 6.3ml 7.5ml 10% SDS 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl 10%過硫酸胺 50μl 100μl 150μl 200μl 250μl 300μl TEMED 2μl 4μl 6μl 8μl 10μl 12μl 配制Tris-甘氨酸 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳5% 濃縮膠溶液 溶液成分 總體積 3ml 總體積 4ml 總體積 5ml 總體積 6ml 總體積 8ml 水 2.1ml 2.7ml 3.4ml 4.1ml 5.5ml 30%丙烯酰胺 0.5ml 0.67ml 0.83ml 1.0ml 1.3ml 1M Tris(pH 6.8) 0.38ml 0.5ml 0.63ml 0.75ml 1.0ml 10% SDS 30μl 40μl 50μl 60μl 80μl 10%過硫酸胺 30μl 40μl 50μl 60μl 80μl TEMED 3μl 4μl 5μl 6μl 8μl |

木蟲 (職業(yè)作家)
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會不會是分離膠中的聚丙酰胺沒有聚合,蛋白沒有孔徑進入分離膠,一般30分鐘左右分離膠都能聚合,TEMED的量不能太多,只是起加速聚合作用,多的話會使膠變硬,變脆,膠容易裂開,蛋白肯定就跑不進孔徑里了。覺得可能還是膠那里出了問題。 http://www.app17.com/dating/d805.html |
| 這個問題我也遇到過,后來解決了。首先分離膠水封或者異丙醇封得時候不能干,也就是說分離膠和濃縮膠之間的界面不能干,這兩個界面很容易有空隙,進入空氣一般就會漏孔。再有就是梳子是不是太緊?梳子太緊容易造成拔梳子的時候將濃縮膠帶起來,和分離膠分離了有空隙。再有就是玻板是不是新的?新的上面有一層油,要洗干凈,否則,膠和板之間容易不緊,造成漏膠。我認為試劑應該沒有太大問題,如果是一直使用的試劑。檢查一下細節(jié)問題吧。 |
金蟲 (小有名氣)
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