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vigaryang木蟲 (正式寫手)
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[求助]
關(guān)于結(jié)構(gòu)優(yōu)化中的對(duì)稱性問題
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| 如果要優(yōu)化一個(gè)像NH3這種明確知道對(duì)稱性的分子，是不是在優(yōu)化時(shí)需要事先指定優(yōu)化過程中對(duì)稱性不變？如果是的話，是通過symmetry(pg=?)實(shí)現(xiàn)呢，還是在分子內(nèi)坐標(biāo)輸入部分設(shè)置變量實(shí)現(xiàn)？網(wǎng)上查了一下，發(fā)現(xiàn)很難見到與symmetry(pg=?)這個(gè)命令有關(guān)的信息，不知是為什么。難道對(duì)于這種分子也不需要指定對(duì)稱性嗎，而任由其自由優(yōu)化嗎。謝謝。 |
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zhangmt
至尊木蟲 (著名寫手)
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如果你在log文件中搜索point group，看到gaussian判定為C1，那么它就按C1優(yōu)化，也就是沒有對(duì)稱性。原因有二： 1、gaussian對(duì)于對(duì)稱性的判定是比較笨的，尤其Oh它經(jīng)常是判定不出來的，這個(gè)應(yīng)該是個(gè)bug，不知道g09改善了沒有； 2、就是判定標(biāo)準(zhǔn)的問題，如果不用內(nèi)坐標(biāo)的形式，那么即便gview給出正確的對(duì)稱性，但gaussian的標(biāo)準(zhǔn)與gview不同，也可能給出不同的結(jié)果。通常是由于笛卡爾坐標(biāo)的精度有限導(dǎo)致的。 |
7樓2011-05-25 14:32:38
zhficcas
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2樓2011-05-23 06:20:29
vigaryang
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3樓2011-05-23 06:47:46
小白如水
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