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bear0329金蟲 (正式寫手)
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[求助]
16s rDNA 擴(kuò)增引物的選擇
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| 各位大俠，小弟是剛接觸PCR，我要擴(kuò)增的是16srDNA,做T-RFLP,那么在引物的選擇方面選什么好點(diǎn)呢？因?yàn)椴煌囊飻U(kuò)增出的片段長度會有差異，這會不會影響后面的分析呢？謝謝 |
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喔喔0208
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weidandande
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【答案】應(yīng)助回帖
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bear0329(金幣+1): 很好啊，謝謝~ 2011-06-07 13:10:31
dhd997(金幣+3): good 2011-06-07 16:55:11
西瓜(金幣+2, EPI+1): Good！ 2011-07-05 17:17:02
bear0329(金幣+1): 很好啊，謝謝~ 2011-06-07 13:10:31
dhd997(金幣+3): good 2011-06-07 16:55:11
西瓜(金幣+2, EPI+1): Good！ 2011-07-05 17:17:02
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個人認(rèn)為，引物的選擇得有以下幾個方面。 1、能夠較為穩(wěn)定的擴(kuò)增，產(chǎn)物單一、明亮； 2、各個引物若都符合上述要求，那么得測序得到序列后再進(jìn)行分析； 3、習(xí)慣上序列長度越大，包含的信息量越多，但也不一定對自己的實(shí)驗(yàn)就好，總之還是得到該物種16SrDNA的長序列后，分析之，在確定使用那一對引物。16SrDNA有許多保守的引物，一開始做的話，盡量選擇具有較長的PCR產(chǎn)物的引物 |
2樓2011-06-07 11:04:04
3樓2011-07-04 10:59:15
xiadongliang
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4樓2011-07-04 14:17:45
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