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[求助]
向RTPCR高手求助,關(guān)于RTPCR的空白對照問題
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| 各位蟲友大家好,我最近初做RTPCR,想請教一下高手是不是用于RTPCR的每對引物使用前都得進行模板為水的空白對照實驗,以確定后期熔解曲線的峰是不是出現(xiàn)了特異性擴增,望高手解答,謝謝!! |
【分子生物】EPI帖 |
木蟲 (著名寫手)
木蟲 (著名寫手)
榮譽版主 (知名作家)
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看空白對照是一個辦法,不過就算加利模板,在融解曲線里也是可以看出引物二聚體的峰的。就算大小差不多,引物二聚體的結(jié)合強度肯定不及PCR產(chǎn)物,Tm值要低些,跟產(chǎn)物相比,出現(xiàn)峰的位置肯定在溫度更低的地方。而且一般峰也相對更低(熒光信號相對弱)。 如果有產(chǎn)物,那擴增曲線很早就會出現(xiàn);如果是30個循環(huán)之后才出現(xiàn)擴增曲線,那可能就是引物二聚體了。 空白對照,應(yīng)該每次PCR里面都加入,可以檢查是否有污染及引物二聚體的情況。 樓主在3樓里擔(dān)心的片段大小與引物二聚體差不多這種情況,應(yīng)該很難出現(xiàn)吧。兩條引物加起來也就50bp不到,而熒光定量PCR的產(chǎn)物一般在150bp到300bp。所以,也可以在PCR之后跑個瓊脂糖凝膠電泳,一般能區(qū)分開PCR產(chǎn)物和引物二聚體。 |
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