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friya0910新蟲 (正式寫手)
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[求助]
酶切的相關(guān)問(wèn)題
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| 本人做蛋白的體外表達(dá),現(xiàn)在已把目的片段連接到T載體測(cè)序(測(cè)序中),上、下游引物分別含有NcoI和BamHI酶切位點(diǎn),可是突然發(fā)現(xiàn)我的T載體在TA克隆位點(diǎn)附近(不超過(guò)10個(gè)堿基)也有BamHI酶切位點(diǎn),那我后續(xù)要用這兩個(gè)酶雙酶切T載體獲得目的基因的話,載體上的BamHI酶切位點(diǎn)對(duì)我后續(xù)實(shí)驗(yàn)的影響大不大啊?懇請(qǐng)高人指點(diǎn)一下! |
【分子生物】EPI帖 |
銀蟲 (小有名氣)
專家顧問(wèn) (知名作家)
生物大分子降解酶
![]() |
專家經(jīng)驗(yàn): +248 |
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BamHI雖然說(shuō)活力比較高,但是也不排除可能有失效或者操作不當(dāng)造成酶切不完全,只能切去其中一個(gè)位點(diǎn)的情況,因?yàn)檫@兩個(gè)位點(diǎn)相隔很近,跑膠的時(shí)候是看不出10個(gè)堿基的差別的,這樣就可能造成回收的外源片段中有一部分還帶有幾個(gè)載體上的堿基。 我建議你設(shè)計(jì)引物的時(shí)候不要選用載體上存在的酶切位點(diǎn),消除這個(gè)隱患。 |

新蟲 (正式寫手)
專家顧問(wèn) (知名作家)
生物大分子降解酶
![]() |
專家經(jīng)驗(yàn): +248 |
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不過(guò)話說(shuō)回來(lái),你為什么要先TA克隆呢?如果PCR出來(lái)之后直接將表達(dá)載體和外源片段雙酶切,然后連接,再轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑取陽(yáng)性單克隆培養(yǎng)提質(zhì)粒,這時(shí)候再測(cè)序就省事了,也不用擔(dān)心你載體上的BamHI酶切位點(diǎn)的干擾了,這樣一來(lái)整個(gè)含有你的片段的質(zhì)粒上就只有一個(gè)BamHI位點(diǎn)了,完全沒(méi)有隱患。 測(cè)序費(fèi)錢也不多,一個(gè)反應(yīng)就30塊錢而已,但可以測(cè)定超過(guò)600bp。 而且要雙向測(cè)通,因?yàn)闇y(cè)序是兩端不準(zhǔn)的,從單鏈得到的結(jié)果可能含有不準(zhǔn)的區(qū)間,需要從另一條單鏈測(cè)得的結(jié)果來(lái)拼接。 |

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