涌動的泉

銅蟲 (知名作家)

[交流] 是密碼子使用偏性相關(guān)的問題，對這方面了解多的蟲蟲進(jìn)來幫幫我啊

認(rèn)真回帖的蟲子，就有機會每個問題拿到10BB。

1.有人說豬的血紅素基因的RSCU值為2，這種說法正確嗎？RSCU的最大值是什么？

2.有人說豬的血紅素基因中的密碼子GGA的CAI值是0.75，這種說法正確嗎？
CAI的最大值是什么？

第一，二題已有好的答案

3.如何進(jìn)行手動識別DAMBE未能識別的tRNA序列中的反密碼子？

4. 我們可以使用什么信息推論出 tRNA 的反密碼子？

5. CAI是用來測量蛋白質(zhì)－密碼子基因的翻譯率嗎？亮氨酸密碼子CUG是第一個具有簡并現(xiàn)象的密碼子嗎？

6. 為什么在富含GC的區(qū)域賴氨酸密碼子的使用往往相對低于富含AT的區(qū)域呢？

7．為什么蛋白質(zhì)的編碼基因轉(zhuǎn)換率比顛換率大呢？

[ Last edited by 涌動的泉 on 2011-7-7 at 08:48 ]

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西瓜

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1樓 2011-07-06 15:27:00

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嚙風(fēng)

銅蟲 (小有名氣)

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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
dhd997(金幣+3): good 2011-07-07 07:43:30
涌動的泉(金幣+10): O(∩_∩)O謝謝提點 2011-07-07 08:12:51

很有意思的題目哦,特別看到樓主的專業(yè)是水產(chǎn)專業(yè),難道是中科系統(tǒng)的?我嘗試發(fā)表一下我的看法：
4. 我們可以使用什么信息推論出 tRNA 的反密碼子？

這個主要是基于CRICK提出的變偶性， tRNA 上的反密碼子與 tRNA 密碼子反向配對時，密碼子第一位、第二位堿基配對是嚴(yán)格的，第三位堿基可以有一定的變動，但是需要注意的是，在反義密碼子里，經(jīng)常在第一位出現(xiàn)次黃嘌呤（I），而他可以與U、A、C三者任一之間形成堿基配對；另外在特殊情況下，反密碼子第一位堿基也可以與密碼子第三位上任意四種堿基配對的，所以比較復(fù)雜。

為什么在富含GC的區(qū)域賴氨酸的使用往往相對低于富含AT的區(qū)域呢？
++++++++++++++++這個吧，賴氨酸的密碼子是AAA，AAAG，~~~~~~當(dāng)然啦，AT RICH 的區(qū)域很多是轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)，和賴氨酸的極性也有點關(guān)系（這點和大家商榷）

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9樓2011-07-06 23:38:13

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冼亮淀粉酶

專家顧問 (知名作家)

★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
涌動的泉(金幣+1): 謝謝你能來 2011-07-06 19:13:58
涌動的泉(金幣+2): 今天順利晉級金蟲，慶祝一下把剩下的BB都散了，O(∩_∩)O~ 2011-07-27 07:26:32
涌動的泉(金幣+5): 2011-07-27 07:29:33

雖然我是豬，但我不了解豬。其它的也很高深，不好意思，辜負(fù)了你的期望。

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2樓2011-07-06 18:43:58

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qhuzhl

金蟲 (小有名氣)

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★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
涌動的泉(金幣+1): 謝謝你能來 2011-07-06 19:14:09
涌動的泉(金幣+2): 今天順利晉級金蟲，慶祝一下把剩下的BB都散了，O(∩_∩)O~ 2011-07-27 07:26:41
涌動的泉(金幣+5): 2011-07-27 07:29:43

我不了解……O(∩_∩)O~

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3樓2011-07-06 19:08:21

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西瓜

榮譽版主 (知名作家)

★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
涌動的泉(金幣+1): 謝謝你能來 2011-07-06 19:14:16
涌動的泉(金幣+2): 今天順利晉級金蟲，慶祝一下把剩下的BB都散了，O(∩_∩)O~ 2011-07-27 07:26:54

本帖通知查看人員
cdl007, 天使托, 西瓜, lxj341401, 冼亮淀粉酶

很少見到有蟲子用這個功能啊，呵呵（版務(wù)倒是經(jīng)常用）

不好意思，辜負(fù)你了，權(quán)當(dāng)頂貼

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4樓2011-07-06 19:10:08

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簡單回復(fù)

wenfuz12樓

2011-07-17 19:21 回復(fù)

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