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angjzy木蟲 (小有名氣)
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[求助]
做cDNA的PCR擴增沒有結(jié)果呀!
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做了一個cDNA,用這段基因擴增actin做陽性對照,能擴增出正確片段。 說明體系、模板都沒問題。 用目的基因特異引物擴增,怎么也擴不出來。 這個引物以前有師兄用過,能正確擴出目的片段。 說明引物序列沒問題。 但現(xiàn)在我做怎么也做不出來。 懷疑引物不好用了, 就用了new aliquote 引物,還是擴不出來。 求助大蝦們,這是怎么個情況呀,怎么能把它弄出來呢? 博士剛開始,就遇到這種問題,崩潰ing~~~ [ Last edited by angjzy on 2011-10-11 at 04:33 ] |
木蟲 (正式寫手)
版筑飯牛的日子
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呵呵 分子方面的實驗就是這個樣子的 總有些說不清道不明的原因 樓主這種原因我以前也經(jīng)常遇到,有時候重復(fù)做幾次PCR就能出來,有時候就是死命都沒結(jié)果。 我的建議就是 1.先重復(fù)幾次實驗,有時候會由于一些比較低級的問題,比如忘加某組分,或者忘記離心,或者其他由于誤差等等原因產(chǎn)生,會出不來結(jié)果,有時候同樣的東西,做兩個重復(fù)也會一個出一個不出,我把這個歸結(jié)為人品不好,暴率比較低的緣故。 2.要弄清楚你擴增片段所處整個mRNA的位置,說簡單點,你的ACTIN能擴出來不代表你的片段能擴增出來,特別是你如果擴增基因全長的時候,因為ACTION往往豐度高,即使有部分RNA降解也很可能有全長。另外即使沒有全長ACTIN,你設(shè)計的引物如果不再整個序列的前端,這個也是說明不了模版質(zhì)量的,總之a(chǎn)ctin的設(shè)計,一定要設(shè)計在序列比較靠末端的位置,用actin檢測模版質(zhì)量,至少需要稀釋100倍檢測。這個是我們實驗室的玩法,非常有效.所以,你應(yīng)該考慮重新提取RNA或者重新反轉(zhuǎn)錄試試結(jié)果。 一點個人看法,希望對你有用,祝實驗成功 |

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