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hlq3175

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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[求助] 【求助】溶劑化效應(yīng)自由能的輸出問(wèn)題

各位高手幫幫忙呀，我需要用g03算一下我的體系的溶劑化自由能 DeltaG (solv)，可是我按照常規(guī)的輸入#p ccsd(t)/6-311++g(d,p) geom=modredundant scf=tight，它并沒(méi)有那一項(xiàng)結(jié)果輸出。根據(jù)小木蟲(chóng)里面找的的帖子，我的輸入文件改成這樣的#p ccsd(t)/6-311++g(d,p) scrf=(pcm,dovacuum,externaliteration) geom=modredundant scf=tight，可是總是出錯(cuò)類似QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE.
t)/6-311++g(d,p) scrf=(pcm,dovacuum,exte
                        '
Last state="SCR2"
TCursr=38161 LCursr= 35
Error termination via Lnk1e in /home/apps/g03/l1.exe at Mon Mar 12 15:39:46 2012.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    8 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1
這些輸入文件里面的字母都是我一個(gè)一個(gè)敲進(jìn)去的，沒(méi)有任何空格，可是一提交就出現(xiàn)莫名其妙的空格，不知道是什么情況？另外能不能解釋一下這兩個(gè)dovacuum,externaliteration的意思，尤其是第一個(gè)，我在03說(shuō)明書(shū)里沒(méi)找到他們的解釋呀，請(qǐng)各位高手給我指點(diǎn)指點(diǎn)。感激不盡呀!

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1樓 2012-03-12 22:47:38

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雨晨田木

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引用回帖:

9樓: Originally posted by boylc789 at 2012-03-31 13:39:39:
能否解釋下，這篇文章的內(nèi)容，有點(diǎn)沒(méi)看明白
作者的意思是說(shuō)用方程4來(lái)計(jì)算溶劑化自由能嗎

對(duì)，但是有個(gè)符號(hào)寫(xiě)錯(cuò)了，Esolv應(yīng)該改成Esoln。就是說(shuō)溶液下溶質(zhì)的總自由能= Esoln（溶液下溶質(zhì)的總能量）+Gnes（溶解增加的自由能）+deltaGcorr_gas（氣相下溶質(zhì)的熱自由能校正）。Esoln+Gnes的值在PCM計(jì)算后在log文件中作為T(mén)otal free energy in solution: with all non electrostatic terms 項(xiàng)自動(dòng)給出，而deltaGcorr_gas是在氣相下作freq計(jì)算后得到的值。注意，在這里溶液和氣相下溶質(zhì)的結(jié)構(gòu)需要分別在液相和氣相重作結(jié)構(gòu)優(yōu)化，很有可能是不一樣的。

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10樓2012-03-31 15:42:11

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雨晨田木

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990(金幣+2): 2012-03-14 11:04:18
hlq3175(金幣+1): ★有幫助, 謝謝您，不過(guò)我要的是溶劑化自由能，這樣子算出來(lái)還是沒(méi)有我要的自由能那一項(xiàng)。 2012-03-14 14:43:25

溶劑效應(yīng)這樣寫(xiě)就行了
%chk=H2O-S.chk
# opt rb3lyp/6-31+g(d,p) SCRF(CPCM,Read,Solvent=Acetonitrile)

H2O Structure in Solution-Phase

0 1
H                0.00000000 0.77125000 -0.46932000
H                0.00000000 -0.77125000 -0.46932000
O                0.00000000 0.00000000 0.11733000

RADII=UAKS

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2樓2012-03-14 10:33:58

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雨晨田木

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【答案】應(yīng)助回帖

對(duì)于???一個(gè)分??結(jié)構(gòu)，分別計(jì)算有無(wú)溶劑效應(yīng)時(shí)的???布斯自由能，其差值自然??就是溶劑化自由能????

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3樓2012-03-14 16:44:41

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
御劍江湖: 金幣+2, 謝謝回帖交流 2012-03-17 18:58:41

溶劑化自由能不就是溶解后的自由能減去溶解前的嗎

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4樓2012-03-14 16:47:01

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