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xiaoyugutou
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如何查找一個基因的轉(zhuǎn)錄起始位點
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| 找到一個基因后,怎樣看哪里是它的轉(zhuǎn)錄起始位點? |
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木蟲 (小有名氣)
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轉(zhuǎn)錄起始位點是指與新生RNA鏈第一個核苷酸相對應DNA鏈上的堿基,通常為一個嘌呤(A或G)。一般轉(zhuǎn)錄起始位點的上游都有雨RNA聚合酶結(jié)合的啟動子區(qū)域,是不是可以根據(jù)這個來大致確定一下你的轉(zhuǎn)錄起始位點。 1.原核生物中,絕大部分啟動子都存在-10bp處的TATA區(qū)和-35bp處的TTGACA區(qū),它們是RNA聚合酶和啟動子的結(jié)合位點,然后看看它大致能不能粗略確定轉(zhuǎn)錄起始位點 2.真核生物鐘,主要的結(jié)合位點是轉(zhuǎn)錄起始位點上游-25~-30bp的TATAAA區(qū)和-70~-78bp的CCAAT區(qū) 3.上NCBI上看看通過基因序列,能不能確定你的轉(zhuǎn)錄起始位點。 祝好運 |
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