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虛謙至尊木蟲 (正式寫手)
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[交流]
怎么能讓amber識(shí)別鈣離子？ 已有1人參與
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最近用amber做一下發(fā)光蛋白的qmmm 里面存在著形成配位鍵的鈣離子 由于Ca的書寫形式 amber總是不認(rèn)識(shí) 上網(wǎng)查了一個(gè)鈣離子的信息 Adding Calcium ion 1. Downloading（metal.prp and metal.mpg） from Amber webside 2. Modify the name of atom in pdb file. 原子名改為 KA 3. The following is the tleap.in (我用的是tleap) 可是改了KA之后 xleap就認(rèn)為變成了鉀了 定義配位鍵根本就不好使 請(qǐng)問怎么能讓amber認(rèn)識(shí)鈣呢？ 剛剛學(xué)習(xí) 問的膚淺的話請(qǐng)見諒 您的一句話可能就幫了我的大忙 各位高手幫幫忙給看看唄 謝謝了 |
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3樓2012-05-28 15:40:38
虛謙
至尊木蟲 (正式寫手)
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2樓2012-05-28 15:13:03
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