 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1621 | 回復: 7 | |||
wawa13998新蟲 (初入文壇)
|
[交流]
求助，CODEHOP 設(shè)計的簡并引物結(jié)果怎么選取~ 已有3人參與
|
|
CODEHOP Results Block unknown__A Oligos I G R R R A V P V I Y L Q G S H Y E V G Y D V G R N F A S I I Q S F L K T Y Q N L R D F E R E Y CAGAACCTGAGGGACTTCgarmrngarta -3' Core: degen=64 len=11 Clamp: score=74, len=18 temp= 60.4 CCTACCAGAACCTGAGGGACttygarmrnga -3' Core: degen=64 len=11 Clamp: score=70, len=20 temp= 60.9 CCTGAAGACCTACCAGAACCTGmrngayttyga -3' Core: degen=64 len=11 Clamp: score=67, len=22 temp= 60.2 CCCACTACGAGGTGGGCtwygaygtngg -3' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=80, len=17 temp= 61.1 GCTCCCACTACGAGGTGggntwygaygt -3' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=80, len=17 temp= 63.0 CCTGCAGGGCTCCCACtaygargtngg -3' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=73, len=16 temp= 62.4 CCTGCAGGGCTCCCAytaygargtng -3' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=75, len=15 temp= 60.5 CCTGCAGGGCTCCcaytaygargt -3' Core: degen=8 len=11 Clamp: score=68, len=13 temp= 60.5 CGTGATCTACCTGCAGGGCTCncaytaygarg -3' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=74, len=21 temp= 64.4 CCGGCGGCGCgyngtnccngt -3' Core: degen=128 len=11 Clamp: score=60, len=10 temp= 63.4 Complement of Block unknown__A Oligos I G R R R A V P V I Y L Q G S H Y E V G Y D V G R N F A S I I Q S F L K T Y Q N L R D F E R E Y crncanggncaCTAGATGGACGTCCCGAGG -5' Core: degen=128 len=11 Clamp: score=74, len=19 temp= 63.4 gtratrctycaCCCGATGCTGCACCC -5' Core: degen=8 len=11 Clamp: score=76, len=15 temp= 61.1 tratrctycancCGATGCTGCACCCGG -5' Core: degen=32 len=12 Clamp: score=76, len=15 temp= 61.3 atrctycanccGATGCTGCACCCGG -5' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=73, len=14 temp= 61.3 ccnawrctrcaCCCGGCCTTGAAGC -5' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=73, len=14 temp= 61.2 awrctrcanccGGCCTTGAAGCGG -5' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=70, len=13 temp= 61.4 ctraarctykyCCTCATG -5' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=79, len=7 temp=-22.4 *** CLAMP NEEDS EXTENSION aarctykynctCATG -5' Core: degen=64 len=11 Clamp: score=79, len=4 temp=-50.7 *** CLAMP NEEDS EXTENSION ctykynctyatG -5' Core: degen=64 len=11 Clamp: score=56, len=1 temp=-140.7 *** CLAMP NEEDS EXTENSION Block unknown__B Oligos N T P T G R N A Y D K T L A N M K Q R Y P Y Y V K E M GCAGCGGTACCCCTACTACgtnaargarat -3' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=79, len=19 temp= 62.6 GAAGCAGCGGTACCCCTACtaygtnaarga -3' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=77, len=19 temp= 60.6 TGAAGCAGCGGTACCCCtaytaygtnaa -3' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=74, len=17 temp= 61.7 CATGAAGCAGCGGTACccntaytaygt -3' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=74, len=16 temp= 60.2 GCCACCGGCCGGrmngcntayga -3' Core: degen=128 len=11 Clamp: score=63, len=12 temp= 60.2 Complement of Block unknown__B Oligos N T P T G R N A Y D K T L A N M K Q R Y P Y Y V K E M ggnatratrcaCTTCCTCTAC -5' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=81, len=10 temp= 26.3 *** CLAMP NEEDS EXTENSION atratrcanttCCTCTAC -5' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=82, len=7 temp= 7.3 *** CLAMP NEEDS EXTENSION atrcanttyctCTAC -5' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=79, len=4 temp=-40.9 *** CLAMP NEEDS EXTENSION canttyctytaC -5' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=58, len=1 temp=-122.8 *** CLAMP NEEDS EXTENSION Block unknown__C Oligos I G T I N D N H S N R N D T G G C S D I A F K S P E N V V L G H T E D A F M E T L N H F Y I M S A H I CATGGAGACCCTGAACCACttytayathatg -3' Core: degen=12 len=12 Clamp: score=79, len=19 temp= 61.3 CATGGAGACCCTGAACCACttytayathat -3' Core: degen=12 len=11 Clamp: score=79, len=19 temp= 61.3 TCATGGAGACCCTGAACcayttytayat -3' Core: degen=8 len=11 Clamp: score=77, len=17 temp= 60.0 GCCTTCATGGAGACCCTGaaycayttyta -3' Core: degen=8 len=11 Clamp: score=73, len=18 temp= 62.5 CCGTCCTGGGCCACacngargaygc -3' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=75, len=14 temp= 62.3 GCCGTCCTGGGCCAyacngargayg -3' Core: degen=32 len=11 Clamp: score=77, len=14 temp= 61.5 GCCGTCCTGGGCcayacngarga -3' Core: degen=16 len=11 Clamp: score=69, len=12 temp= 61.5 ATCGGCACCathaaygayaa -3' Core: degen=12 len=11 Clamp: score=75, len=9 temp= 36.8 *** CLAMP NEEDS EXTENSION ATCGGCACnathaaygaya -3' Core: degen=48 len=11 Clamp: score=85, len=8 temp= 14.5 *** CLAMP NEEDS EXTENSION ATCGGCacnathaayga -3' Core: degen=24 len=11 Clamp: score=74, len=6 temp= 14.5 *** CLAMP NEEDS EXTENSION ATCggnacnathaa -3' Core: degen=48 len=11 Clamp: score=74, len=3 temp=-27.4 *** CLAMP NEEDS EXTENSION 本人新手一枚，老板讓設(shè)計簡并引物，我用CODEHOP設(shè)計后不知道怎么選取 求教一下 CODEHOP的結(jié)果中是怎么選取適合的引物的？ 還有其中的degen= 是什么意思? 還有我可以從A里面選一個上游引物，B或者C里面選一個下游引物嗎？ |
回復此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗中的趣事：實驗器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗中的趣事：和實驗材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復
-
化學工程及工業(yè)化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有85人回復
-
蛋白質(zhì)檢測：精準分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴謹設(shè)計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標南京
已經(jīng)有0人回復
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 測序結(jié)果分析，以及RACE引物設(shè)計。求助呢
已經(jīng)有3人回復
- 利用CODEHOP和iCODEHOP 設(shè)計簡 并引物
已經(jīng)有129人回復
- ——CODEHOP簡并引物設(shè)計程序的疑惑
已經(jīng)有9人回復
- 【求助/交流】設(shè)計的簡并引物擴不出目的條帶，求助
已經(jīng)有18人回復
- 【求助/交流】緊急求助~~ 關(guān)于簡并引物設(shè)計 codehop 和genefisher 在線
已經(jīng)有12人回復
- 【求助/交流】同源克隆設(shè)計的引物Tm值過低怎么辦
已經(jīng)有12人回復
- 【求助/交流】簡并引物設(shè)計軟件
已經(jīng)有9人回復
- 【求助/交流】問個白癡的問題，怎么設(shè)計引物并加上酶切位點？！
已經(jīng)有7人回復
- 【求助/交流】（引物設(shè)計）怎么防止pET28a中Nco1的ATG影響目的基因的表達？
已經(jīng)有9人回復
- 【求助/交流】NCBI中對設(shè)計的引物blast時E值怎么看？
已經(jīng)有5人回復
- 【求助/交流】codehop設(shè)計的引物怎么修改？
已經(jīng)有9人回復
- 【求助/交流】新手請教如何對不同物種中某一酶的氨基酸序列進行比對再設(shè)計簡并引物啊?/a>
已經(jīng)有10人回復
wawa13998
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 52.3
- 帖子: 33
- 在線: 10.2小時
- 蟲號: 1543816
- 注冊: 2011-12-19
- 性別: MM
- 專業(yè): 農(nóng)業(yè)昆蟲學
2樓2012-12-09 20:11:48
guxinhan123
銀蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 60 (初中生)
- 金幣: 361.8
- 紅花: 5
- 帖子: 322
- 在線: 179.7小時
- 蟲號: 526470
- 注冊: 2008-03-16
- 專業(yè): 中藥資源
3樓2012-12-10 12:39:35
4樓2012-12-10 19:58:16
wawa13998
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 52.3
- 帖子: 33
- 在線: 10.2小時
- 蟲號: 1543816
- 注冊: 2011-12-19
- 性別: MM
- 專業(yè): 農(nóng)業(yè)昆蟲學
5樓2012-12-11 08:57:58
wawa13998
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 52.3
- 帖子: 33
- 在線: 10.2小時
- 蟲號: 1543816
- 注冊: 2011-12-19
- 性別: MM
- 專業(yè): 農(nóng)業(yè)昆蟲學
6樓2012-12-11 08:59:34
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
|
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3011161,看看這個帖子，對于用icodehop設(shè)計兼并引物講的很詳細。 |
7樓2012-12-11 10:45:31
8樓2016-10-21 16:18:52
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 wawa13998 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 本人考085602 化學工程 專碩 +17 | 不知道叫什么！ 2026-03-15 | 19/950 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 化學求調(diào)劑 +3 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑 +7 | 小材化本科 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | ydfyh 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 +8 | 妮妮ninicgb 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 司空. 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩調(diào)劑 +5 | 204818@lcx 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +6 | 26研0 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +8 | 戲精丹丹丹 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +8 | 陌宸希 2026-03-16 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料與化工專碩調(diào)劑 +5 | heming3743 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿南京大學，080500材料科學與工程，調(diào)劑 +4 | Jy? 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿，福州大學材料專碩339分求調(diào)劑 +3 | 木子momo青爭 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[基金申請]
今年的國基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 080500，材料學碩302分求調(diào)劑學校 +4 | 初識可樂 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +4 | 學海漂泊 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 冬十三 2026-03-13 | 3/150 |
|