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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » PDB文件拆分
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PDB文件拆分
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| 請問一個復合蛋白質（蛋白質結合）PDB文件，怎么拆分成單個蛋白質的PDB文件？直接刪除不需要蛋白質的序列跟坐標嗎？ |
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
harrymao: 金幣+5, ★★★★★最佳答案, 我用perl程序拆分 原來很簡單 2013-05-15 17:28:23
感謝參與，應助指數(shù) +1
harrymao: 金幣+5, ★★★★★最佳答案, 我用perl程序拆分 原來很簡單 2013-05-15 17:28:23
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1、直接刪除不需要蛋白質的序列跟坐標，可行！ 2、用VMD 命令，你需要知道你要選擇的蛋白質，比如說 resid 10-25 則： set sel [atomselect top "resid >=10 and resid <=25"] $sel writepdb protein_ok.pdb 這樣就把你選擇的蛋白質保存在了 protein_ok.pdb 里。 在vmd中這句 set sel [atomselect top "resid >=10 and resid <=25"] 可以根據(jù)你自己的需求，有好多種選擇的辦法 |
2樓2013-05-15 14:51:57
xulinan
木蟲 (小有名氣)
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- 專業(yè): 微生物生理與生物化學
3樓2013-05-15 14:54:20
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