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hwchen2000金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
單條3-race通用引物擴(kuò)增出5-6個(gè)條帶,有沒(méi)有
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各位大俠,最近在做PCR,本來(lái)是想做3-race的,沒(méi)做出來(lái),后來(lái)受壇子里的一個(gè)蟲(chóng)友啟發(fā),只用巢式引物和3-通用引物擴(kuò)增出6個(gè)條帶,結(jié)果測(cè)序結(jié)果回來(lái)不可思議,上游引物居然就是3-通用引物的互補(bǔ)序列,下游引物就是3-通用引物,后來(lái)用3-通用引物做單引物擴(kuò)增,這6個(gè)條帶居然全擴(kuò)出來(lái),真是奇葩了,有沒(méi)有筒子能解釋一下啊 3-通用引物5'-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACGGCATGACAGTG (T)18-3' |
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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巢式PCR第一輪的時(shí)候如果有非特異的引物/模板結(jié)合, 這種PCR產(chǎn)物就會(huì)在第二輪繼續(xù)被擴(kuò)增. 樓主的第一輪巢式PCR溫度太低了. 通用引物里面的poly-T和模板末端的poly-A(對(duì)應(yīng)原來(lái)mRNA的poly-A)這種結(jié)合是你希望發(fā)生的, 但是如果有某個(gè)cDNA中間也有和poly-A相似序列, 你的通用引物也可以勉強(qiáng)集合上, 只要這個(gè)發(fā)生就會(huì)給下面的PCR提供模板. |
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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