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關(guān)于未知菌的16s rDNA序列在ncbi上分析的結(jié)果很奇怪 已有1人參與
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做了差不多一個(gè)月的分子實(shí)驗(yàn)，小小本科生到現(xiàn)在都還沒(méi)回家，班上女生就我一個(gè)沒(méi)回去過(guò)了，各種想家啊。昨天上海那邊終于把測(cè)序結(jié)果返過(guò)來(lái)，很奇怪，blast后發(fā)現(xiàn)貌似沒(méi)有芽孢桿菌的類(lèi)似菌做對(duì)比，相反都是沒(méi)有芽孢的菌，（挑去培養(yǎng)一天的單菌落，做過(guò)芽孢染色，知道至少是芽孢桿菌），做實(shí)驗(yàn)的時(shí)候覺(jué)得可能自己無(wú)菌操作有問(wèn)題，因?yàn)榕囵B(yǎng)液渾濁沉淀根本不一樣，有的有分層，有的是均勻的渾濁，各位大神也可以幫忙看下我發(fā)的另外一帖子（http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6209229），里面有關(guān)于無(wú)菌操作現(xiàn)象的詳細(xì)描述。 然后我查了下給出的類(lèi)似菌種，發(fā)現(xiàn)大多是桿菌，只是沒(méi)芽孢，跟我鏡檢下的情況也類(lèi)似，因?yàn)檠挎呷旧Ч焕硐�，大多只能看到桿菌，而且培養(yǎng)時(shí)間16個(gè)小時(shí)，看不到大量芽孢，所以不確定是否染菌了，但是這個(gè)結(jié)果返回來(lái)之后，我就慌了，沒(méi)一種是芽孢桿菌，是不是真的意味著我操作有問(wèn)題啊，全錯(cuò)啊。還是我自己不會(huì)用blast，技術(shù)渣啊？我把序列附上了，希望大神幫我看下是不是真的不是芽孢桿菌。如果不是，我實(shí)驗(yàn)就全白搭了，時(shí)間也浪費(fèi)了，錢(qián)也浪費(fèi)了，好心疼，好想家啊。  cry: |
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2013-08-15 20:10:00, 1.26 K
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eagles123
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還是看質(zhì)量 [ Last edited by eagles123 on 2013-8-15 at 21:46 ] |
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