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關(guān)于未知菌的16s rDNA序列在ncbi上分析的結(jié)果很奇怪 已有1人參與
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做了差不多一個(gè)月的分子實(shí)驗(yàn),小小本科生到現(xiàn)在都還沒回家,班上女生就我一個(gè)沒回去過了,各種想家啊。昨天上海那邊終于把測序結(jié)果返過來,很奇怪,blast后發(fā)現(xiàn)貌似沒有芽孢桿菌的類似菌做對比,相反都是沒有芽孢的菌,(挑去培養(yǎng)一天的單菌落,做過芽孢染色,知道至少是芽孢桿菌),做實(shí)驗(yàn)的時(shí)候覺得可能自己無菌操作有問題,因?yàn)榕囵B(yǎng)液渾濁沉淀根本不一樣,有的有分層,有的是均勻的渾濁,各位大神也可以幫忙看下我發(fā)的另外一帖子(http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6209229),里面有關(guān)于無菌操作現(xiàn)象的詳細(xì)描述。 然后我查了下給出的類似菌種,發(fā)現(xiàn)大多是桿菌,只是沒芽孢,跟我鏡檢下的情況也類似,因?yàn)檠挎呷旧Ч焕硐耄蠖嘀荒芸吹綏U菌,而且培養(yǎng)時(shí)間16個(gè)小時(shí),看不到大量芽孢,所以不確定是否染菌了,但是這個(gè)結(jié)果返回來之后,我就慌了,沒一種是芽孢桿菌,是不是真的意味著我操作有問題啊,全錯(cuò)啊。還是我自己不會(huì)用blast,技術(shù)渣啊?我把序列附上了,希望大神幫我看下是不是真的不是芽孢桿菌。如果不是,我實(shí)驗(yàn)就全白搭了,時(shí)間也浪費(fèi)了,錢也浪費(fèi)了,好心疼,好想家啊。 cry: |
金蟲 (正式寫手)
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