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1M Tris溶解多肽為什么溶液變粘稠?
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RT,我無意中拿了1M的Tris-Hcl 溶解了一個(gè)多肽,結(jié)果溶液變的粘稠,而用10mM的Tris以及hepes、NaAC-HAC這些緩沖液溶解都沒有類似的情況。這個(gè)1M Tris溶的肽我拿去和銅離子滴定,發(fā)現(xiàn)有結(jié)合,而溶在其他buffer里的同樣的肽卻沒有結(jié)合,這是什么原因?是因?yàn)檫@個(gè)肽只有在這么高濃度的tris里才能有特定的結(jié)構(gòu)和銅結(jié)合還是高濃度的Tris和肽發(fā)生了什么反應(yīng)導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)儀器誤判,和銅無關(guān)? 我的這個(gè)肽長24個(gè)aa,偏堿性,偏親水性。 |
木蟲 (正式寫手)
| 1。tris本身含氨基,能和銅絡(luò)合。2.1M的tris本身就有點(diǎn)粘,但不明顯,可能是多肽在水中溶解度有限,而tris競爭了大量的氫鍵導(dǎo)致肽成凝膠狀,估計(jì)再加tris,肽就要析出了。3.不排除多肽在高鹽情況下出現(xiàn)了組裝,或形成了特定的高級結(jié)構(gòu)。4.LZ可以用相應(yīng)離子強(qiáng)度的非氨體系試試能否重復(fù)出這個(gè)結(jié)果,再試試無機(jī)氨體系,看是不是Tris的專有反應(yīng)(Tris含氨基和羥基,都可以配位Cu) |
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我用空白的1Mtris和銅滴定沒有峰出現(xiàn)。我用幾個(gè)位點(diǎn)突變了的此肽溶于1Mtris和銅滴定也沒有峰。。。看上去似乎還是和此肽有關(guān)。不過我這個(gè)肽是在公司合成的,拿到手的時(shí)候感覺沒有凍干,不是那種凍干粉的狀態(tài),而是冰塊狀,然后我拿這個(gè)肽去做出了那次有峰的結(jié)果,后來我覺得這個(gè)肽不保險(xiǎn),就讓公司重新凍干了(還是冰塊狀,但是體積縮。┲蠼o我,我再去拿了用10mM的Tris溶了就做不出來了。那銷售說可能第一次的里面會殘留有乙腈,但是技術(shù)卻一口咬定不會有乙腈。我對這個(gè)合成不懂,似乎是用反相色譜,報(bào)告單上寫著A相是TFA。。乙腈應(yīng)該是能和銅結(jié)合的,不過凍在-80度里乙腈不會揮發(fā)掉嗎?而且就算有殘余稀釋到實(shí)驗(yàn)濃度時(shí)是不是已經(jīng)很少了?。不知道是因?yàn)榈谝淮蔚碾睦锩嬗幸译娉霈F(xiàn)了假象,還是因?yàn)榈诙慰桃庠偃龈墒沟么穗氖艿搅似茐。。。。糾結(jié)無比,難道此實(shí)驗(yàn)將永無定論? |
木蟲 (正式寫手)
| 1.一般凍干前會旋蒸掉乙腈和TFA,否則傷凍干機(jī),但由于TFA和多肽的氨基成鹽會殘余一些。2.一般只要不反復(fù)凍融多肽還是穩(wěn)定的。凍干不會影響多肽的。3.會不會和肽的濃度有關(guān),因?yàn)槎嚯牡臓顟B(tài)不同質(zhì)量稱量可能誤差很大。建議用紫外光譜看看定一下濃度(如果用HPLC定量更準(zhǔn))4.先別急,先想好兩次實(shí)驗(yàn)的差異,再一個(gè)因素一個(gè)因素的加上去。tris-HCl pH值是不變的,乙腈可能會對多肽的結(jié)構(gòu)有影響,摻入微量的乙腈試試。另外該肽有無半胱氨酸這樣的不穩(wěn)定氨基酸或二硫鍵,穩(wěn)定性如何?實(shí)在不行也別放在心上,畢竟只是意外的收獲,原定的實(shí)驗(yàn)計(jì)劃還是主要的。 |
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