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轉(zhuǎn)錄組測序的拼接 已有1人參與
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最近要做一個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析,在轉(zhuǎn)錄組測序上有一些問題,希望高手們能夠指導(dǎo)一下。 是無參考基因的轉(zhuǎn)錄組測序,用的DE novo拼接,測了4個(gè)樣品 4個(gè)樣品的reads放在一起拼接,reads拼接得到contig,contig再拼接得到轉(zhuǎn)錄本,這時(shí)得到的每個(gè)轉(zhuǎn)錄本之間有重復(fù)序列嗎? 公司給的說明上還有一句話看不明白: Unigene序列,每個(gè)Loci下取最長轉(zhuǎn)錄本作Unigene 。 不明白這個(gè)unigene是怎么來的。 希望高手們指導(dǎo)一下。謝謝了 |
至尊木蟲 (著名寫手)
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