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gong_107

金蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 環(huán)境污染化學(xué)

[求助] 請教關(guān)于LST/QST的問題已有1人參與

請問該圖的過程是如何得到的呢, 當(dāng)用 Dmol3計(jì)算時,選擇TS模塊下的LST/QST. 但我不明白的是,這個程序在開始TS運(yùn)行前,需要標(biāo)定(匹配)反應(yīng)前后的原子, 但想要了解如圖所示那樣,需要知道H2O在這個表面的吸附和解吸附的過程,原本就不知道反應(yīng)后是發(fā)生了什么,也不知道解吸附后的H和OH在表面的那個位置與其他的原子結(jié)合(該圖是TiO2(110)面). 如何運(yùn)行啊? 哪位高人指點(diǎn)下,不用說那么多細(xì)節(jié),只大概解釋下大的整體步驟就行! 十分感謝

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1樓 2014-04-01 14:27:14

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liebegll

木蟲 (小有名氣)

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【答案】應(yīng)助回帖

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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gong_107: 金幣+20, ★★★很有幫助 2014-04-02 10:20:34

按照你所展示的圖，使用LST/QST方法尋找的是IS和FS之間的TS。首先你需要選取許多不同的吸附位點(diǎn)優(yōu)化得到一些吸附結(jié)構(gòu)（IS），比較吸附能可以畫出SS到IS這一步的能量變化；然后以這些優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)，結(jié)合實(shí)驗(yàn)或者是理論推測結(jié)果推測水解離形成的H和OH的吸附狀態(tài)，再次優(yōu)化得到不同的FS。這些工作做完以后，使用reaction preview，匹配IS和FS的所有對應(yīng)原子，得到一個軌跡文件，以這個文件作為輸入文件可以執(zhí)行LST/QST尋找TS的計(jì)算任務(wù)

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回復(fù)此樓

2樓2014-04-01 16:50:46

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