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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 第一性原理 » MS » 請教關于LST/QST的問題
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[求助]
請教關于LST/QST的問題 已有1人參與
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請問該圖的過程是如何得到的呢, 當用 Dmol3計算時,選擇TS模塊下的LST/QST. 但我不明白的是,這個程序在開始TS運行前,需要標定(匹配)反應前后的原子, 但想要了解如圖所示那樣,需要知道H2O在這個表面的吸附和解吸附的過程,原本就不知道反應后是發(fā)生了什么,也不知道解吸附后的H和OH在表面的那個位置與其他的原子結合(該圖是TiO2(110)面). 如何運行啊? 哪位高人指點下,不用說那么多細節(jié),只大概解釋下大的整體步驟就行! 十分感謝 1.jpg |
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liebegll
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| 按照你所展示的圖，使用LST/QST方法尋找的是IS和FS之間的TS。首先你需要選取許多不同的吸附位點優(yōu)化得到一些吸附結構（IS），比較吸附能可以畫出SS到IS這一步的能量變化；然后以這些優(yōu)化后的結構為基礎，結合實驗或者是理論推測結果推測水解離形成的H和OH的吸附狀態(tài)，再次優(yōu)化得到不同的FS。這些工作做完以后，使用reaction preview，匹配IS和FS的所有對應原子，得到一個軌跡文件，以這個文件作為輸入文件可以執(zhí)行LST/QST尋找TS的計算任務 |
2樓2014-04-01 16:50:46
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