版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實(shí)名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號(hào)能夠正常使用，請(qǐng)盡快對(duì)帳號(hào)進(jìn)行手機(jī)號(hào)驗(yàn)證，感謝您的理解與支持！

24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜

返回列表

1113046083

金蟲(chóng) (小有名氣)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 1503.5
帖子: 53
在線: 123.6小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 2041376
注冊(cè): 2012-10-03
性別: GG
專業(yè): 金屬結(jié)構(gòu)材料

[求助] VASP分子動(dòng)力學(xué)可視化問(wèn)題

VASP在算分子動(dòng)力學(xué)時(shí)，想看看動(dòng)力學(xué)過(guò)程是怎么運(yùn)行的，網(wǎng)上有說(shuō)用xdat2xyz.pl生成movie.xyz，然在再通過(guò)jmol軟件進(jìn)行查看，但怎樣來(lái)執(zhí)行xdat2xyz.pl, 其操作命令是什么？請(qǐng)哪一位蟲(chóng)友指點(diǎn)一二

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

08工學(xué)調(diào)劑已經(jīng)有17人回復(fù)
340求調(diào)劑已經(jīng)有4人回復(fù)
311求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
0805 316求調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)
食品專碩一志愿雙一流 328 已經(jīng)有4人回復(fù)
材料調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)
300分，材料，求調(diào)劑，英一數(shù)二已經(jīng)有5人回復(fù)
求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分已經(jīng)有5人回復(fù)
085600材料與化工調(diào)劑已經(jīng)有13人回復(fù)
材料與化工考研調(diào)劑已經(jīng)有7人回復(fù)

» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

Vasp相比經(jīng)典分子動(dòng)力學(xué)的優(yōu)缺點(diǎn) 已經(jīng)有11人回復(fù)
一種p4vasp配合VASP模擬STM圖的方法已經(jīng)有224人回復(fù)
分子動(dòng)力學(xué)軟件的選擇？已經(jīng)有8人回復(fù)
VASP結(jié)果分析求助已經(jīng)有6人回復(fù)
求vasp輸出文件的分析已經(jīng)有5人回復(fù)
關(guān)于VASP計(jì)算得到CHGCAR文件的數(shù)據(jù)處理以及數(shù)據(jù)單位的已經(jīng)有16人回復(fù)
分子動(dòng)力學(xué)模擬時(shí)如何利用周期性邊界條件？？已經(jīng)有5人回復(fù)
（文獻(xiàn)學(xué)習(xí)）一篇計(jì)算HfO2表面結(jié)構(gòu)與原子性質(zhì)的文章已經(jīng)有26人回復(fù)
vasp計(jì)算界面結(jié)構(gòu)時(shí)原子弛豫的問(wèn)題已經(jīng)有12人回復(fù)
VASP做分子動(dòng)力學(xué)模擬的時(shí)候，CONTCAR文件能不能刪除掉修正的部分直接使用？已經(jīng)有3人回復(fù)
VASP計(jì)算：如何處理波函數(shù)占用空間太大的問(wèn)題已經(jīng)有5人回復(fù)
【求助】VASP做分子動(dòng)力學(xué)模擬NVT系綜下為啥內(nèi)能竟然是升高的？已經(jīng)有8人回復(fù)
Vasp中刪除一個(gè)鍵輸入文件如何表現(xiàn)出來(lái)？已經(jīng)有8人回復(fù)
【任務(wù)征集】VASP跑分子動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)處理方法已經(jīng)有20人回復(fù)
【活動(dòng)】vasp計(jì)算分子動(dòng)力學(xué)討論合集及專貼（籌劃中）已經(jīng)有33人回復(fù)
【求助】關(guān)于vasp進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬的求助已經(jīng)有12人回復(fù)
【求助】請(qǐng)教vasp計(jì)算恒溫第一原理分子動(dòng)力學(xué) 已經(jīng)有9人回復(fù)
【求助】vasp分子動(dòng)力學(xué)模擬求助已經(jīng)有15人回復(fù)
【neweroica個(gè)人文集】最新版vaspmo (v0.1) ――可視化VASP分子軌道已經(jīng)有103人回復(fù)

既然選擇了遠(yuǎn)方，便只顧風(fēng)雨兼程！

1樓 2014-05-30 16:36:03

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lsl6585

銀蟲(chóng) (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 443
帖子: 24
在線: 10.7小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 565453
注冊(cè): 2008-05-29
專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)

直接用VMD打開(kāi)計(jì)算結(jié)束之后生成的vasprun.xml文件看行不行

xdat2xyz.pl XDATCAR, 記得把xdat2xyz.pl所在的文件夾添加到你linux的PATH里面

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

2樓2014-05-30 21:28:22

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn) 我要訂閱樓主 1113046083 的主題更新