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金蟲(chóng) (小有名氣)

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專(zhuān)業(yè): 金屬結(jié)構(gòu)材料

[求助] VASP分子動(dòng)力學(xué)可視化問(wèn)題

VASP在算分子動(dòng)力學(xué)時(shí)，想看看動(dòng)力學(xué)過(guò)程是怎么運(yùn)行的，網(wǎng)上有說(shuō)用xdat2xyz.pl生成movie.xyz，然在再通過(guò)jmol軟件進(jìn)行查看，但怎樣來(lái)執(zhí)行xdat2xyz.pl, 其操作命令是什么？請(qǐng)哪一位蟲(chóng)友指點(diǎn)一二

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既然選擇了遠(yuǎn)方，便只顧風(fēng)雨兼程！

1樓 2014-05-30 16:36:03

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lsl6585

銀蟲(chóng) (初入文壇)

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專(zhuān)業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)

直接用VMD打開(kāi)計(jì)算結(jié)束之后生成的vasprun.xml文件看行不行

xdat2xyz.pl XDATCAR, 記得把xdat2xyz.pl所在的文件夾添加到你linux的PATH里面

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回復(fù)此樓

2樓2014-05-30 21:28:22

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