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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 綜合其他 » 轉錄組測序的生物學重復問題
| 查看: 7974 | 回復: 12 | ||||
liyongrui1鐵桿木蟲 (著名寫手)
木蟲
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[求助]
轉錄組測序的生物學重復問題 已有10人參與
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現(xiàn)在進行轉錄組測序是否必須進行生物學重復啊，是否要3個重復。是否可以用3個樣品的RNA等量混合代替生物學重復？如果不重復能否發(fā)文章？主要是經費有限 |
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【答案】應助回帖
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liyongrui1(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵回帖交流 2014-06-18 10:40:02
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liyongrui1(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵回帖交流 2014-06-18 10:40:02
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最近一直在琢磨這個問題�，F(xiàn)在基本上測轉錄組數(shù)據(jù)都沒有生物學重復，見了幾個之前做芯片的客戶，想做測序，問我測序技術為什么不需要生物學重復，我一時還真沒回答上來。 實際來看，絕大多數(shù)發(fā)表的轉錄組文獻都不做生物學重復，再有就是測序的成本還是挺高的，所以大家默認都不做生物學重復。 給你一個文獻看看吧： Sequencing technology does not eliminate biological variability. Kasper D Hansen, Zhijin Wu, Rafael A Irizarry & Jeffrey T Leek. Nat Biotechnol., 2011. 29(7): 572–573. |
2樓2014-06-18 10:36:47
12樓2014-07-15 14:05:52
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10樓2014-06-26 19:04:58
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