 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3220 | 回復(fù): 8 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
zhzj2011新蟲(chóng) (初入文壇)
|
[求助]
gromacs進(jìn)行分子模擬時(shí)，pdb2gmx不認(rèn)識(shí)小分子殘基，怎么辦，以及如何導(dǎo)入糖的力場(chǎng) 已有4人參與
|
|
|
最近在學(xué)習(xí)gromacs，在用pdb2gmx生成topology文件時(shí)，pdb2gmx不識(shí)別蛋白中的殘基，該怎么辦來(lái)獲得完整的topology文件，還有怎么在gromacs中導(dǎo)入其他力場(chǎng)，如Martini力場(chǎng)？ 我完全是一個(gè)新手，之前是學(xué)純生物的，物理、化學(xué)知識(shí)就只有高中學(xué)的，過(guò)來(lái)人有沒(méi)有什么建議?不勝感激！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
材料學(xué)碩333求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
289求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
收08調(diào)劑生
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料專碩找調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085602 289分求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
化工專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
274求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
08工學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
招08考數(shù)學(xué)
已經(jīng)有16人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 求助：gromacs怎樣進(jìn)行REMD的計(jì)算？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 請(qǐng)教gromacs蛋白與小分子相互作用分析
已經(jīng)有12人回復(fù)
- gromacs安裝后無(wú)法使用
已經(jīng)有5人回復(fù)
- GROMACS運(yùn)行完后的結(jié)果分析
已經(jīng)有4人回復(fù)
- gromacs安裝好后運(yùn)行pdb2gmx顯示還未安裝pdb2gmx呢？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- Gromacs中添加CHARMM力場(chǎng)
已經(jīng)有41人回復(fù)
- gromacs中的top文件
已經(jīng)有16人回復(fù)
- gromacs 添加新的力場(chǎng)pdb2gmx報(bào)錯(cuò)
已經(jīng)有5人回復(fù)
- gromacs無(wú)法生成gro文件
已經(jīng)有5人回復(fù)
- gromacs自己添加residue遇到的問(wèn)題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- gromacs NEMD模擬
已經(jīng)有12人回復(fù)
- gromacs 模擬NPT系宗出問(wèn)題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- gromacs，用pdb文件生成top文件時(shí)遇到的問(wèn)題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- gromacs模擬分子在二氧化硅表面的吸附
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 如何使用gromacs進(jìn)行多分子模擬？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 請(qǐng)教GROMACS安裝
已經(jīng)有8人回復(fù)
- GROMACS 小分子top文件
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 在gromacs中運(yùn)行mdrun命令時(shí)出錯(cuò)
已經(jīng)有10人回復(fù)
- gromacs 運(yùn)行pdb2gmx中出錯(cuò)，pdb2gmx: error while loading shared libraries
已經(jīng)有3人回復(fù)
- [新手求教]安裝Gromacs后，查看pdb2gmx命令，顯示無(wú)此命令
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】如何使用gromacs中的constraint
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】這是我安裝gromacs過(guò)程，但是出錯(cuò)阿，這個(gè)怎么辦呢？謝謝
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】gromacs的又一個(gè)問(wèn)題
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】在gromacs的gro中插入小分子
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助】求一個(gè)gromacs的中文教程，包括安裝的部分，小弟新手，從零學(xué)起
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】求GROMACS模擬表面活性劑在油水表面的行為的例子
已經(jīng)有7人回復(fù)
SunnyRain0.0
金蟲(chóng) (正式寫手)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 1564.1
- 散金: 1
- 紅花: 7
- 帖子: 624
- 在線: 146.8小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1711069
- 注冊(cè): 2012-03-23
- 性別: MM
- 專業(yè): 中藥學(xué)其他科學(xué)問(wèn)題
9樓2014-11-10 21:43:03
zhzj2011
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 86.5
- 帖子: 4
- 在線: 91.8小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 3362628
- 注冊(cè): 2014-08-12
- 專業(yè): 發(fā)育生物學(xué)
2樓2014-08-21 15:27:22
fangsteel
木蟲(chóng) (正式寫手)
- 應(yīng)助: 96 (初中生)
- 金幣: 1213.6
- 散金: 32
- 紅花: 22
- 帖子: 456
- 在線: 192.1小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2248690
- 注冊(cè): 2013-01-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 原子和分子物理
3樓2014-08-22 10:20:17
zhzj2011
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 86.5
- 帖子: 4
- 在線: 91.8小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 3362628
- 注冊(cè): 2014-08-12
- 專業(yè): 發(fā)育生物學(xué)
4樓2014-08-23 09:36:01
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0854電子信息求調(diào)劑 +5 | α____ 2026-03-22 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿211 初試270分 求調(diào)劑 +5 | 谷雨上岸 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿武漢理工大學(xué)材料工程（085601） +5 | WW.' 2026-03-23 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 07化學(xué)280分求調(diào)劑 +4 | 722865 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料專碩英一數(shù)二306 +8 | z1z2z3879 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 336求調(diào)劑 +4 | 收到VS 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +4 | LHHL66 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求老師收我 +3 | zzh16938784 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿海大，0703化學(xué)學(xué)碩304分，有大創(chuàng)項(xiàng)目，四級(jí)已過(guò) +6 | 幸運(yùn)哩哩 2026-03-22 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 324求調(diào)劑 +6 | lucky呀呀呀鴨 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)調(diào)劑 +5 | Surekei 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | Zhangbod 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] 山東省面上項(xiàng)目限額評(píng)審 +4 | 石瑞0426 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑 +4 | 沿岸有貝殼6 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +12 | 呼呼呼。。。。 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 22 350 本科985求調(diào)劑，求老登收留 +3 | 李軼男003 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +5 | 申子申申 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] A區(qū)線材料學(xué)調(diào)劑 +5 | 周周無(wú)極 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +11 | Ymlll 2026-03-18 | 15/750 |
|