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dfysyer

木蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 藥劑學(xué)

[求助] 質(zhì)粒構(gòu)建長短問題

大家好，由于實(shí)驗(yàn)中遇到一個關(guān)于質(zhì)粒構(gòu)建問題現(xiàn)在無法解決特到此求大神們指點(diǎn)迷津哈。
事情是這樣的，我想看看一個叫做GJa的基因里面的NF-kB結(jié)合位點(diǎn)對該基因表達(dá)的影響。于是就按著一篇文獻(xiàn)上的方法找到了其中的NF-kB結(jié)合位點(diǎn)。但是問題來了，文章中居然做了兩個長度的片段。而且貌似也沒有說這兩個片段長度有何區(qū)別。而自己按著該位點(diǎn)進(jìn)行突變的話可以只整一個300多bp的質(zhì)粒，實(shí)驗(yàn)結(jié)果也表明了該位點(diǎn)能夠影響Gja的表達(dá)。所以我很疑惑為何文章里面做了258和699這兩個長度的片段。
下面我就給出了Gja基因的啟動子區(qū)域，其中大寫字母為外顯子起始部分（只copy了一小部分哈

）
下劃線部分就是包含了NF-kB結(jié)合部位的序列

貌似和文獻(xiàn)上的也是反的。。。。。。
然后我把文獻(xiàn)也放上來了。如果有大神能解決這個問題的話必有重謝哈。（或者文獻(xiàn)本身就有問題？）先在此跪謝了

ggtggtggaggaggaggaggagggagggaggggaggg
ggagaattttggcatcttcctgccgatttaaatgctaaattgtagtcatg
aataggactgagataggacgttcacttcctcggagactgggtagaggtca
gtatcaacgtttcagtccaaagttacctacatgatatttttcataataca
taacatctaccttcctgttcttaatcgaaggaatacacaaaactatctaa
agcagcagagaaaccgacgagtagacatacccctccactggggctggttg
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tgcctgctcagccccacgttcgtcagcctcctccccaccttctccccgcc
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附件 1 : AnangiotensinII-andNF-kappaB-dependentmechanismincreasesconnexin43inmurinearteriestargetedbyrenin-dependenthypertension.pdf

2014-12-06 20:21:49, 713.55 K

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1樓 2014-12-06 20:23:01

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