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kobe6777新蟲 (小有名氣)
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[求助]
CI-NEB過渡態(tài)搜索腳本應(yīng)用及處理問題
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我用CI-NEB搜索到過渡態(tài)后用nebresults.pl腳本處理數(shù)據(jù)，生成一些列文件，在neb.dat中的數(shù)據(jù)都表示什么意思��？ 0 0.000000 0.000000 0.000000 0 1 1.360466 0.000674 -0.067762 1 2 2.719057 2.251713 0.000777 2 3 3.440332 0.005108 1.945967 3 4 4.161964 -0.380791 0.019030 4 5 4.884291 -0.385686 0.000000 5 1、第二例是image間的距離，他這個(gè)具體是怎么計(jì)算的啊？ 2、第三列是能壘，第四列是每個(gè)imag收到的力，這個(gè)力指的是什么力？怎么判斷他們符不符合標(biāo)準(zhǔn)�。肯Ｍ苷f的具體點(diǎn)！我看他們對(duì)應(yīng)著輸出文件里的這個(gè)NEB: projections on to tangent (spring, REAL) -3.186584 0.000777 REAl的這個(gè)值 還有在nebef.dat中 0 0.000000 -38.792300 0.000000 1 0.009502 -38.791600 0.000700 2 0.009501 -36.540500 2.251800 3 0.004749 -38.787100 0.005200 4 0.007105 -39.173000 -0.380700 5 0.000000 -39.177900 -0.385600 第四列所表示的受力指的是什么力��？我在OUTCAR中沒有找到相應(yīng)的數(shù)值。。。 怎么判斷算的過渡態(tài)和其他的點(diǎn)在不在同一個(gè)勢(shì)能曲面上啊？ 希望高手能指點(diǎn)指點(diǎn)！ |
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NEB的思想是使各個(gè)Image能量盡量低，同時(shí)又保持連續(xù)。所謂連續(xù)是指，對(duì)于一個(gè)Image，它是前后兩個(gè)Image的線性組合。 用dft可以計(jì)算出原子受力情況，沿著受力方向移動(dòng)可以降低能量。同樣的，為了保持連續(xù)，NEB虛構(gòu)了一個(gè)彈性力，當(dāng)Image不是線性組合時(shí)，這個(gè)力會(huì)把Image拉向前后兩Image之間。原子受力和彈性力的合力就是NEB的收斂條件。 因?yàn)闆]用過vtst，不清楚樓主文件中的力是不是上述的合力。 個(gè)人理解，如有不當(dāng)請(qǐng)多指教。 |
5樓2017-03-18 12:58:58
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