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kobe6777新蟲 (小有名氣)
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CI-NEB過渡態(tài)搜索腳本應(yīng)用及處理問題
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我用CI-NEB搜索到過渡態(tài)后用nebresults.pl腳本處理數(shù)據(jù)，生成一些列文件，在neb.dat中的數(shù)據(jù)都表示什么意思啊？ 0 0.000000 0.000000 0.000000 0 1 1.360466 0.000674 -0.067762 1 2 2.719057 2.251713 0.000777 2 3 3.440332 0.005108 1.945967 3 4 4.161964 -0.380791 0.019030 4 5 4.884291 -0.385686 0.000000 5 1、第二例是image間的距離，他這個具體是怎么計算的��？ 2、第三列是能壘，第四列是每個imag收到的力，這個力指的是什么力？怎么判斷他們符不符合標(biāo)準(zhǔn)啊？希望能說的具體點！我看他們對應(yīng)著輸出文件里的這個NEB: projections on to tangent (spring, REAL) -3.186584 0.000777 REAl的這個值 還有在nebef.dat中 0 0.000000 -38.792300 0.000000 1 0.009502 -38.791600 0.000700 2 0.009501 -36.540500 2.251800 3 0.004749 -38.787100 0.005200 4 0.007105 -39.173000 -0.380700 5 0.000000 -39.177900 -0.385600 第四列所表示的受力指的是什么力��？我在OUTCAR中沒有找到相應(yīng)的數(shù)值。。。 怎么判斷算的過渡態(tài)和其他的點在不在同一個勢能曲面上��？ 希望高手能指點指點！ |
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kobe6777
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