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關(guān)于測序后基因分型的一些問題。。。求大神解答！ 已有1人參與
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本人對分子生物相關(guān)的一些東西都不太懂，只會做PCR來檢測，但是老板要求要做到基因分型，查了一些文獻(xiàn)，但是沒有一個很好的思路所以來請教各位大神！ 我要對樣本中的隱孢子蟲SSU基因進(jìn)行檢測并且測序，最后是要鑒定到基因型。 首先，每種隱孢子蟲就有很多的基因型，文獻(xiàn)中所選擇的基因型用于比對的基因型也不相同。那么我該如何從基因庫里面選擇出可用于我比對的這些基因型呢？其次，我直接把測序結(jié)果來BLAST，會出來20多個結(jié)果，identity也有99%，但是都是isolates，沒有出現(xiàn)相應(yīng)的基因型編號。那這樣分到型了嗎？ 最后，我想知道這個試驗(yàn)的步驟到底是怎樣的？是我先用酶切確定我得到幾個型再去找相應(yīng)比對型呢？還是直接找來比對型進(jìn)行比對，最后出結(jié)果？ 希望知道的大神告訴我該怎么做。。。從基因型的選擇開始我就不會弄了。。。 |
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2樓2015-03-12 19:09:44
zss2011
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 652
- 帖子: 30
- 在線: 10.2小時
- 蟲號: 1266014
- 注冊: 2011-04-15
- 性別: MM
- 專業(yè): 環(huán)境工程
3樓2015-04-17 11:27:25
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