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duyang1217鐵蟲 (小有名氣)
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[交流]
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序正常分析會(huì)得到大量的差異基因的進(jìn)一步分析 已有8人參與
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| 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序正常分析會(huì)得到大量的差異基因，之后大家都不知道如何進(jìn)行下面的試驗(yàn)，不知所從，我現(xiàn)在在此基礎(chǔ)上繼續(xù)閱讀大量文獻(xiàn)分析得到更少的候選基因，有沒有意義？能發(fā)文章嗎？大家有什么看法，可以發(fā)表下意見。 |
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duyang1217
鐵蟲 (小有名氣)
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3樓2015-03-30 15:18:41
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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你要先問問自己當(dāng)初為什么做這個(gè)分析。是因?yàn)榉椒▽W(xué)比較時(shí)髦、大家都在做？還是自己想解決某個(gè)具體問題，需要做這一分析。如果是前者，大概就會(huì)落到目前的狀態(tài)：下一步該怎么做、甚至如何分析、利用所得到的結(jié)果都不知道怎么做了。 任何兩種條件下都會(huì)有許多差異表達(dá)的基因，這是毫無(wú)疑問的。所以單純找出一大把的差異基因不能說(shuō)沒有意義，而只能說(shuō)是這是問題的開始而不是結(jié)束。所以單憑這些結(jié)果不能說(shuō)發(fā)不了文章，但肯定發(fā)不了好的文章，因?yàn)檫@只是故事的開始。 你可以通過各種分析、統(tǒng)計(jì)手段表面這些差異基因是真的差異。但必需有個(gè)validation的過程，當(dāng)然顯然不需要所有的都去驗(yàn)證，但至少有驗(yàn)證若干有代表性的基因，而且盡可能在mRNA和蛋白水平上進(jìn)行驗(yàn)證。具體選擇哪些基因，則取決于你開始做這個(gè)分析的初衷，或者說(shuō)你要解決的主要問題。當(dāng)然驗(yàn)證完畢后還需要后續(xù)各種工作的繼續(xù)和深入，如差異基因的表達(dá)調(diào)控、生物學(xué)功能的檢測(cè)和相關(guān)機(jī)制、siganling pathway的分析等等，才算得上一篇完整的論文。 |
5樓2015-04-01 10:22:46
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