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seamas_gao1銀蟲 (小有名氣)
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請問轉(zhuǎn)錄組測序中的index是什么意思，與adapter有什么區(qū)別？ 已有1人參與
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請問轉(zhuǎn)錄組測序中的index是什么意思，與adapter有什么區(qū)別？ 我在看illumina的說明書時(shí)發(fā)現(xiàn)有很多關(guān)于index和adapter的說明，不明白二者有什么區(qū)別，好像index一般是很短的序列，而adapter是較長的序列。請問在trim時(shí)，對(duì)index和adapter分別應(yīng)該怎樣做呢？謝謝 這是illumina的說明書的一部分。 無標(biāo)題.png |
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yuehedou
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adapter是接頭，分為pcr擴(kuò)增接頭和測序接頭，分別用于文庫構(gòu)建和測序的引物。 index是索引序列，為區(qū)分不同樣本而構(gòu)建。高通量測序一次一塊板要加好多樣品，如果你的樣品少那單獨(dú)測你的測序公司就虧了，因此把你的和別人的樣品放到一起，分別加個(gè)index用以區(qū)分，測序結(jié)束后就可以根據(jù)index來分離單個(gè)樣本了。 |
2樓2014-04-14 08:59:55
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7樓2014-08-26 22:31:42
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