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seamas_gao1銀蟲 (小有名氣)
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請(qǐng)問轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中的index是什么意思，與adapter有什么區(qū)別？ 已有1人參與
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請(qǐng)問轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中的index是什么意思，與adapter有什么區(qū)別？ 我在看illumina的說明書時(shí)發(fā)現(xiàn)有很多關(guān)于index和adapter的說明，不明白二者有什么區(qū)別，好像index一般是很短的序列，而adapter是較長(zhǎng)的序列。請(qǐng)問在trim時(shí)，對(duì)index和adapter分別應(yīng)該怎樣做呢？謝謝 這是illumina的說明書的一部分。 無標(biāo)題.png |
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seamas_gao1
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adapter是接頭，分為pcr擴(kuò)增接頭和測(cè)序接頭，分別用于文庫構(gòu)建和測(cè)序的引物。 index是索引序列，為區(qū)分不同樣本而構(gòu)建。高通量測(cè)序一次一塊板要加好多樣品，如果你的樣品少那單獨(dú)測(cè)你的測(cè)序公司就虧了，因此把你的和別人的樣品放到一起，分別加個(gè)index用以區(qū)分，測(cè)序結(jié)束后就可以根據(jù)index來分離單個(gè)樣本了。 |
2樓2014-04-14 08:59:55
gaoyang636
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5樓2014-04-17 21:53:13
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