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bayu18新蟲 (正式寫手)
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如何比對(duì)出外顯子和內(nèi)含子 已有2人參與
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各位大俠： 我做的這種植物基因組未知，我通過(guò)PCR獲得了某個(gè)基因的cDNA序列和相應(yīng)的DNA序列，請(qǐng)問(wèn)用什么軟件可以比對(duì)出哪部分是外顯子和內(nèi)含子。急，萬(wàn)分感謝。 PS：我用DNAman比對(duì)，只比出來(lái)了一段外顯子，其他的都比對(duì)錯(cuò)位了。 |
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bayu18
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liuderong
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| 有DNA和cDNA做blast就行了，http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=align2seq，這個(gè)網(wǎng)站有兩個(gè)方框，把DNA和cDNA分別放到兩個(gè)框里，順序不論，然后點(diǎn)擊blast應(yīng)該就看到結(jié)果了。 |
2樓2015-03-30 20:23:48
bayu18
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3樓2015-03-31 08:34:14
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5樓2015-03-31 08:38:06
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