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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » PCR相關 » 如何比對出外顯子和內含子
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bayu18新蟲 (正式寫手)
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如何比對出外顯子和內含子 已有2人參與
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各位大俠： 我做的這種植物基因組未知，我通過PCR獲得了某個基因的cDNA序列和相應的DNA序列，請問用什么軟件可以比對出哪部分是外顯子和內含子。急，萬分感謝。 PS：我用DNAman比對，只比出來了一段外顯子，其他的都比對錯位了。 |
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liuderong
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【答案】應助回帖
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bayu18(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+1, 鼓勵回帖交流 2015-03-30 20:48:27
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| 有DNA和cDNA做blast就行了，http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=align2seq，這個網站有兩個方框，把DNA和cDNA分別放到兩個框里，順序不論，然后點擊blast應該就看到結果了。 |
2樓2015-03-30 20:23:48
bayu18
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7樓2015-03-31 08:54:10
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8樓2015-03-31 11:12:26
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9樓2015-03-31 11:14:22
10樓2015-03-31 13:43:53
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