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bayu18新蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何比對出外顯子和內(nèi)含子 已有2人參與
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各位大俠: 我做的這種植物基因組未知,我通過PCR獲得了某個(gè)基因的cDNA序列和相應(yīng)的DNA序列,請問用什么軟件可以比對出哪部分是外顯子和內(nèi)含子。急,萬分感謝。 PS:我用DNAman比對,只比出來了一段外顯子,其他的都比對錯(cuò)位了。 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
| 有DNA和cDNA做blast就行了,http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=align2seq,這個(gè)網(wǎng)站有兩個(gè)方框,把DNA和cDNA分別放到兩個(gè)框里,順序不論,然后點(diǎn)擊blast應(yīng)該就看到結(jié)果了。 |
新蟲 (正式寫手)
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新蟲 (正式寫手)

鐵桿木蟲 (正式寫手)
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