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bayu18新蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何比對出外顯子和內(nèi)含子 已有2人參與
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各位大俠： 我做的這種植物基因組未知，我通過PCR獲得了某個基因的cDNA序列和相應(yīng)的DNA序列，請問用什么軟件可以比對出哪部分是外顯子和內(nèi)含子。急，萬分感謝。 PS：我用DNAman比對，只比出來了一段外顯子，其他的都比對錯位了。 |
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6樓2015-03-31 08:39:03
liuderong
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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bayu18(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+1, 鼓勵回帖交流 2015-03-30 20:48:27
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bayu18: 金幣+4, ★★★很有幫助 2015-03-31 08:34:26
| 有DNA和cDNA做blast就行了，http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=align2seq，這個網(wǎng)站有兩個方框，把DNA和cDNA分別放到兩個框里，順序不論，然后點擊blast應(yīng)該就看到結(jié)果了。 |
2樓2015-03-30 20:23:48
bayu18
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3樓2015-03-31 08:34:14
bayu18
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4樓2015-03-31 08:37:06
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