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rola234新蟲 (小有名氣)
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[求助]
PCR擴增沒有結(jié)果,求教是引物Tm值相差太大,還是模板GC含量太高? 已有8人參與
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| 這兩天通過PCR擴增一個基因,基因本身比較長,大約1800bp左右,這個基因序列的GC含量為66%,總體上看還算正常,但當(dāng)中有三四個區(qū)段的GC含量特別特別高,就是出現(xiàn)連續(xù)幾十個甚至上百個GC堿基這樣的序列,我設(shè)計的上游引物Tm之大約50.6℃,下游引物引物帶入了一個NotI酶切位點,因此Tm值達到了66.8℃,兩個引物的Tm值相差得有點大,今天試著做了一次PCR,但沒有結(jié)果,我將退火溫度從50℃到65℃做了一個梯度,但P了10管,都沒有結(jié)果,非特異性擴增也幾乎沒有,只有最下面有一些引物二聚體。我確信我沒有加錯或者漏加?xùn)|西,而且瓊脂糖電泳也沒有問題,就不太清楚到底是什么導(dǎo)致了PCR擴增沒有結(jié)果,考慮來考慮去,覺得只有引物和模板的問題比較大,但不確定問題到底出在哪,求教小木蟲上的各位高手了! |

新蟲 (小有名氣)

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