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LeonardoChen金蟲 (小有名氣)
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[求助]
重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后提的平板有很多菌落，但是菌落PCR 沒有結(jié)果。 已有3人參與
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重組質(zhì)粒PET28a，轉(zhuǎn)化到大腸桿菌（BL21），涂布到平板，37℃，培養(yǎng)14h左右，單菌落數(shù)有很多然后隨機挑取10單菌落，加入50微升無菌水，煮沸40min，做菌落PCR，第一次pcr體系是：10微升buffer ，1微升Taq ，1微升dNTP MIX ，1微升T7引物 ，1微升T7Terminator ，86微升無菌水。分裝每管9微升，再加入1微升煮沸的菌液，進行PCR，跑膠結(jié)果顯示有陽性克隆，但是測序結(jié)果顯示都是假陽性。 第二次嘗試用另一種方法：10微升buffer ，1微升Taq ，1微升dNTP MIX ，1微升T7Terminator ，1微升引物R（就是自己剛開始做克隆設(shè)計的引物） ，86微升無菌水。分裝每管9微升，再加入1微升煮沸的菌液，進行PCR，跑膠結(jié)果顯示都沒有陽性克隆。 PCR反應(yīng)條件：95℃ 5min，Sample Text 72℃ 10min，4.0℃ pause 各位能不能幫我分析下，為什么單菌落那么多卻沒有陽性克隆，如果是實驗操作的原因最可能會出現(xiàn)在哪一步？謝謝，不甚感激！ |
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你先測序看重組質(zhì)粒是否正確，有可能是載體自連 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2015-09-27 22:59:35
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3樓2015-10-12 13:19:54
4樓2015-10-12 14:01:02
高gaoeryang
銀蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
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- 專業(yè): 生物化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
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從你的描述來看，第一次用載體上引物進行菌落PCR驗證，出現(xiàn)陽性克隆，但測序不對；第二次用載體和片段的引物，未出現(xiàn)陽性克隆。 一般來講，質(zhì)粒轉(zhuǎn)BL21成功率很高，你得到了較多的轉(zhuǎn)化子，轉(zhuǎn)化應(yīng)該是沒有問題的。 可以繞過菌落PCR驗證，選擇4~10個轉(zhuǎn)化子進行酶切驗證，因為菌落PCR假陽性較高 一定要菌落PCR的話用你的第二次方法，多挑點轉(zhuǎn)化子，一次做30個，嘿嘿 還有從你的描述上看你才做了一次轉(zhuǎn)化，也可以再重復(fù)一次看看 再給你個經(jīng)驗，盡量挑取菌落小的克隆子，分散著挑別扎堆 這個都是模式化的操作，沒問題的，再試試唄 |
5樓2015-10-12 17:24:09
【答案】應(yīng)助回帖
商家已經(jīng)主動聲明此回帖可能含有宣傳內(nèi)容|
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6樓2015-10-15 12:31:01
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