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LeonardoChen金蟲 (小有名氣)
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[求助]
重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后提的平板有很多菌落,但是菌落PCR 沒有結(jié)果。 已有3人參與
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重組質(zhì)粒PET28a,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌(BL21),涂布到平板,37℃,培養(yǎng)14h左右,單菌落數(shù)有很多然后隨機(jī)挑取10單菌落,加入50微升無菌水,煮沸40min,做菌落PCR,第一次pcr體系是:10微升buffer ,1微升Taq ,1微升dNTP MIX ,1微升T7引物 ,1微升T7Terminator ,86微升無菌水。分裝每管9微升,再加入1微升煮沸的菌液,進(jìn)行PCR,跑膠結(jié)果顯示有陽(yáng)性克隆,但是測(cè)序結(jié)果顯示都是假陽(yáng)性。 第二次嘗試用另一種方法:10微升buffer ,1微升Taq ,1微升dNTP MIX ,1微升T7Terminator ,1微升引物R(就是自己剛開始做克隆設(shè)計(jì)的引物) ,86微升無菌水。分裝每管9微升,再加入1微升煮沸的菌液,進(jìn)行PCR,跑膠結(jié)果顯示都沒有陽(yáng)性克隆。 PCR反應(yīng)條件:95℃ 5min,Sample Text 72℃ 10min,4.0℃ pause 各位能不能幫我分析下,為什么單菌落那么多卻沒有陽(yáng)性克隆,如果是實(shí)驗(yàn)操作的原因最可能會(huì)出現(xiàn)在哪一步?謝謝,不甚感激! |
禁蟲 (初入文壇)
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你先測(cè)序看重組質(zhì)粒是否正確,有可能是載體自連 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
銀蟲 (小有名氣)
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從你的描述來看,第一次用載體上引物進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,出現(xiàn)陽(yáng)性克隆,但測(cè)序不對(duì);第二次用載體和片段的引物,未出現(xiàn)陽(yáng)性克隆。 一般來講,質(zhì)粒轉(zhuǎn)BL21成功率很高,你得到了較多的轉(zhuǎn)化子,轉(zhuǎn)化應(yīng)該是沒有問題的。 可以繞過菌落PCR驗(yàn)證,選擇4~10個(gè)轉(zhuǎn)化子進(jìn)行酶切驗(yàn)證,因?yàn)榫銹CR假陽(yáng)性較高 一定要菌落PCR的話用你的第二次方法,多挑點(diǎn)轉(zhuǎn)化子,一次做30個(gè),嘿嘿 還有從你的描述上看你才做了一次轉(zhuǎn)化,也可以再重復(fù)一次看看 再給你個(gè)經(jīng)驗(yàn),盡量挑取菌落小的克隆子,分散著挑別扎堆 這個(gè)都是模式化的操作,沒問題的,再試試唄 |
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