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wuyuanqing金蟲 (正式寫手)
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[求助]
重組質(zhì)粒的驗證 已有2人參與
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| 各位大俠,本人最近做一個克隆,轉(zhuǎn)化后挑取單克隆,LB搖菌后,進行菌液PCR,引物為我克隆基因的上下游引物,結(jié)果顯示,有兩個克隆出現(xiàn)目的大小條帶,而且亮度很大(遠遠高于marker中最亮的條帶),于是信心滿滿地提取質(zhì)粒進行酶切驗證,結(jié)果,電泳顯示無任何條帶,將質(zhì)粒上樣后也五條帶,懷疑是試劑盒的問題后,換一種試劑盒提取,提取物上樣電泳顯示,沒有質(zhì)粒。這是為什么呢?請賜教,謝謝! |
金蟲 (小有名氣)
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我來完整解答你的問題。 首先,你的菌液PCR設(shè)計方式不對。從連接轉(zhuǎn)化到挑單克隆菌液PCR這一套完整流程走下來,你最開始做連接的PCR產(chǎn)物還是殘留在體系里的,他們并沒有反應(yīng)完全,可能隨后續(xù)的操作一直存在于體系中(注意是可能,不是一定,不要鉆牛角尖啊, ), 僅憑你槍頭的觸碰就足夠進入你菌液PCR的體系成為模板被擴增出來。要充分注意PCR的靈敏度,即使稀釋百萬倍,輕微觸碰,都可能被檢測出來,造成判斷失誤(血淚教訓(xùn)。所以,你在設(shè)計菌液PCR驗證的時候必須避開這個問題,避免被殘留的可能存在的成分干擾你的判斷。一般載體引物一對+PCR產(chǎn)物本身引物一對嵌套檢測是比較靠譜的,出來兩個條帶如果差異大小正確基本就不會出問題了。 |

金蟲 (正式寫手)
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新蟲 (正式寫手)
銀蟲 (小有名氣)

金蟲 (正式寫手)
金蟲 (正式寫手)
送紅花一朵 |
謝謝你的建議,我這是連續(xù)做了五個克隆后第六個出現(xiàn)這個問題,一直想不通,看來以后需要這樣設(shè)計引物了。另外請教一下,如果是殘留,為何會在抗性培養(yǎng)基里生長卻沒有質(zhì)粒? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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